Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K0

BCL11B, B-cell lymphoma/leukemia 11B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL11BQ9C0K0 ABRACL-202ENST00000461027 456 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 AC129807.1-201ENST00000471614 591 ntTSL 4 BASIC10.36□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 OR52A4P-201ENST00000472867 958 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 AC044836.1-201ENST00000519514 274 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 OPRK1-204ENST00000524278 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 AC079363.1-201ENST00000551366 1125 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 AC092868.1-201ENST00000557949 802 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 CCDC32-210ENST00000559911 677 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 MDFIC2-201ENST00000567252 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 AC125421.2-201ENST00000580370 583 ntTSL 4 BASIC10.36□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 AC006504.2-201ENST00000589471 458 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 AC003991.1-201ENST00000594469 484 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 CT45A9-201ENST00000604569 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 AP001442.1-201ENST00000617755 659 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 AC243725.1-201ENST00000637164 436 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 CABYR-207ENST00000486759 1664 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 OR4P4-202ENST00000641760 2086 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 HEPH-206ENST00000441993 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 RIOK2-201ENST00000283109 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 AL590999.1-201ENST00000607675 3776 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 E2F8-201ENST00000250024 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 SCG3-201ENST00000220478 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 OFD1P6Y-201ENST00000432335 1637 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 TTTY9B-201ENST00000433794 1637 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 DDX24-205ENST00000555054 2769 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 CRYBG3-201ENST00000389622 10729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 DCSTAMP-208ENST00000622554 1471 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 ZNF827-203ENST00000508784 7463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 THAP12P1-201ENST00000398672 2203 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 AL023806.3-201ENST00000638502 2704 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 CHD7-201ENST00000423902 11568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 SPTAN1-223ENST00000630866 7498 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 AP002358.1-201ENST00000399003 2805 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 FNDC7-201ENST00000370017 3332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 LINC01060-204ENST00000510832 2435 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 MTND5P23-201ENST00000430812 1655 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 PTGS2-201ENST00000367468 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 ARMC3-202ENST00000376528 3258 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 SPARCL1-205ENST00000503414 2520 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 CASP7-207ENST00000452490 2271 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 CRYGS-201ENST00000307944 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 RN7SKP184-201ENST00000362348 333 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 NDRG3-204ENST00000373803 2978 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 SLC2A11-205ENST00000403208 564 ntTSL 4 BASIC10.35□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 SNORA11D-201ENST00000408548 128 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 SNORA11E-201ENST00000408778 128 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 AL713965.1-201ENST00000421166 230 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 FBP2P1-202ENST00000424473 530 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 DDX11L10-201ENST00000430178 571 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 AC092167.1-201ENST00000435466 495 ntTSL 4 BASIC10.35□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 FMO7P-201ENST00000436045 768 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 AC005099.1-201ENST00000442083 610 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 RPS4XP4-201ENST00000443195 763 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 AC022387.1-201ENST00000444770 794 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 HMGB1P16-201ENST00000447155 540 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 AL590490.1-201ENST00000455599 316 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 RPS4XP12-201ENST00000461747 709 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 RPS7P6-201ENST00000485777 579 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 ZCCHC10-203ENST00000504170 325 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 AC068672.1-201ENST00000520391 328 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 OR4A11P-201ENST00000529557 906 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 FOLH1B-202ENST00000529567 2145 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 AC009387.1-201ENST00000549163 441 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 LINC00640-201ENST00000554409 498 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 AL160191.1-201ENST00000555480 566 ntTSL 4 BASIC10.35□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 AC006504.5-202ENST00000586784 656 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 AL161729.2-201ENST00000605700 456 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 AC016747.2-201ENST00000605902 364 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 AL133351.5-201ENST00000612789 106 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 TEX46-203ENST00000622840 479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 AC010533.1-201ENST00000624875 2105 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 GAS2-210ENST00000630668 674 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 AL513321.2-202ENST00000634479 921 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 ADAM7-204ENST00000520720 1870 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 TMEM144-216ENST00000514558 3699 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 EYA3-203ENST00000373871 6085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 AP001157.1-201ENST00000550837 2339 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 MLANA-203ENST00000381477 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 B3GALT5-202ENST00000380618 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 CSNK2A1-201ENST00000217244 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 HSD11B1-203ENST00000367028 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 CEP290-207ENST00000552810 7948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
BCL11BQ9C0K0 CALCOCO2-201ENST00000258947 3682 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 161 ms