Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 LINC2194-201ENST00000567127 454 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AC022916.2-201ENST00000590144 559 ntTSL 4 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AL353811.1-202ENST00000602614 618 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AC004921.1-201ENST00000608884 733 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AC104836.2-201ENST00000609675 1293 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AC006924.1-201ENST00000610750 559 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AC097372.4-201ENST00000625025 466 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 NRXN1-223ENST00000625891 1164 ntTSL 4 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AL355480.1-201ENST00000629041 99 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 CASC15-208ENST00000636388 1174 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AD000090.1-201ENST00000638356 494 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 MKL2-202ENST00000571589 8799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 SV2B-202ENST00000394232 11279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 LINC01415-201ENST00000587320 4071 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 VPS13B-202ENST00000357162 14019 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 CR1-201ENST00000367049 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 DOCK11P1-201ENST00000553480 5932 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 OLMALINC-203ENST00000641087 3779 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 DNAL1-202ENST00000553645 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AC009804.2-201ENST00000637566 3032 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 LINC01606-203ENST00000519160 2292 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 SLC2A14-221ENST00000616981 3366 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 GUCY1B2-204ENST00000531898 1979 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 OR52N1-202ENST00000641645 2545 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 CCAR1-201ENST00000265872 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 HSDL2-201ENST00000398803 2983 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AC009779.8-201ENST00000641684 4384 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 TOR1AIP2-201ENST00000367612 7905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 CAPSL-201ENST00000397366 969 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 UBE2V1P14-201ENST00000415815 558 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 DCN-203ENST00000420120 753 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 GRM7-AS3-203ENST00000424366 486 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AC011891.1-201ENST00000437088 432 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 DCN-205ENST00000441303 519 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AC002553.3-201ENST00000453002 341 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 HGF-207ENST00000453018 721 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 DCN-206ENST00000456569 228 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 MIR205HG-209ENST00000458250 406 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 SNX18P26-201ENST00000458433 740 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AC118282.1-201ENST00000506408 765 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AC025768.1-201ENST00000510057 267 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 UGT2A3P7-201ENST00000510485 734 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AC110760.3-202ENST00000515177 371 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 HGNC:24955-208ENST00000521585 1260 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AC091819.2-201ENST00000522292 490 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 KCTD21-AS1-203ENST00000527321 586 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 TRIM51DP-201ENST00000529746 596 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AP004609.2-201ENST00000532177 190 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AP001858.2-201ENST00000536213 601 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AC027667.1-201ENST00000545814 304 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 NPIPB1P-201ENST00000547442 1129 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AC089998.2-201ENST00000551856 277 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AC012050.1-201ENST00000558185 472 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AC011270.1-201ENST00000558606 583 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AC233702.7-202ENST00000582941 211 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AC244131.2-201ENST00000612592 512 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AL096712.1-201ENST00000614561 159 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 Metazoa_SRP.199-201ENST00000615501 281 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 NBPF25P-202ENST00000619932 3827 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 LINC00284-211ENST00000620454 534 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AC090772.4-201ENST00000623599 362 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 TIMM21-201ENST00000169551 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AC005674.2-201ENST00000561486 3510 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 LGSN-204ENST00000622415 1612 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 CDK14-206ENST00000436577 4787 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 SLC4A10-204ENST00000421911 3398 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 CCDC178-209ENST00000579947 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 OR4K13-202ENST00000641664 5980 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 CPS1-212ENST00000619804 1542 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 LINC01138-208ENST00000639159 1521 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 CHD6-203ENST00000373233 10818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 FASTKD2-203ENST00000403094 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 MSR1-202ENST00000350896 3572 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AC079753.1-201ENST00000623243 3868 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AC098798.1-201ENST00000503998 1447 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 NUF2-202ENST00000367900 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 PDGFRA-206ENST00000508170 2202 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 TLR10-207ENST00000613579 3801 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AC092724.1-201ENST00000624623 3397 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 Z98257.1-202ENST00000431027 2493 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 TRAPPC3L-201ENST00000356128 2421 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 DOCK9-208ENST00000448493 7887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 HBG1-201ENST00000330597 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 TAF13-201ENST00000338366 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 SNORA21-201ENST00000362423 132 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 SPHAR-201ENST00000366688 648 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 MIR7-1-201ENST00000384871 110 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
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