Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 SNRPEP5-201ENST00000425442 278 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AC092162.2-203ENST00000430460 579 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
FXNQ16595 EMC3-AS1-204ENST00000430621 683 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AC022537.1-201ENST00000435271 446 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
FXNQ16595 GABRG3-AS1-201ENST00000439938 970 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
FXNQ16595 DSCAM-IT1-201ENST00000440363 720 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
FXNQ16595 ARL4AP3-201ENST00000441452 574 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
FXNQ16595 ARL5AP2-201ENST00000444698 533 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
FXNQ16595 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AC007000.1-201ENST00000453064 794 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
FXNQ16595 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
FXNQ16595 OR7E62P-201ENST00000456741 477 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
FXNQ16595 RPL35AP19-201ENST00000469425 329 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
FXNQ16595 RN7SL797P-201ENST00000486314 297 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
FXNQ16595 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
FXNQ16595 LINC02005-201ENST00000498832 782 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
FXNQ16595 OR5H7P-201ENST00000514084 930 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
FXNQ16595 GPX8-208ENST00000515370 1036 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AC073581.1-201ENST00000519036 575 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AC084816.1-202ENST00000536744 647 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
FXNQ16595 LYZ-203ENST00000549690 669 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
FXNQ16595 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
FXNQ16595 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
FXNQ16595 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
FXNQ16595 MIR5095-201ENST00000578844 88 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
FXNQ16595 USP2-AS1-205ENST00000578923 895 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
FXNQ16595 RN7SL835P-201ENST00000579920 262 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
FXNQ16595 C17orf80-208ENST00000582793 531 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
FXNQ16595 SS18L2P2-201ENST00000583960 235 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AC006116.9-201ENST00000591630 649 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AC092902.2-202ENST00000599350 686 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AC129492.5-201ENST00000603489 315 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AL035661.1-201ENST00000620459 1144 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AC026124.2-201ENST00000621847 656 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AC012560.1-201ENST00000634930 459 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
FXNQ16595 FGL2-202ENST00000637771 989 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
FXNQ16595 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
FXNQ16595 TRPM6-204ENST00000449912 8244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
FXNQ16595 BMPR1B-202ENST00000394931 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
FXNQ16595 OR4F17-202ENST00000585993 2669 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
FXNQ16595 C2CD5-212ENST00000542676 3438 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
FXNQ16595 PRND-201ENST00000305817 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
FXNQ16595 ARHGAP32-202ENST00000392657 6556 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
FXNQ16595 CREM-202ENST00000342105 1541 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
FXNQ16595 ZNF415-204ENST00000594011 2630 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
FXNQ16595 NUMB-204ENST00000535282 3198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
FXNQ16595 MBNL3-203ENST00000370849 1444 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
FXNQ16595 TRIM60P14-201ENST00000513444 1419 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
FXNQ16595 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
FXNQ16595 ANKFN1-201ENST00000318698 2426 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AC105114.1-201ENST00000624795 1862 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
FXNQ16595 OR2T2-203ENST00000642130 3331 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
FXNQ16595 MEF2C-226ENST00000625674 4343 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
FXNQ16595 KLF7-201ENST00000309446 8362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
FXNQ16595 CDC40-201ENST00000307731 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
FXNQ16595 SOCS5P5-201ENST00000402732 1586 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
FXNQ16595 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
FXNQ16595 BEST3-202ENST00000330891 3532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
FXNQ16595 MCFD2-202ENST00000409105 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
FXNQ16595 PSG6-202ENST00000292125 1391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
FXNQ16595 TRIM55-203ENST00000350034 1177 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
FXNQ16595 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
FXNQ16595 MXI1-204ENST00000369612 879 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
FXNQ16595 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
FXNQ16595 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
FXNQ16595 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
FXNQ16595 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
FXNQ16595 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
FXNQ16595 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
FXNQ16595 RPL23A-203ENST00000394938 688 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
FXNQ16595 MSRB1P1-201ENST00000396851 354 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
FXNQ16595 ELMO1-AS1-201ENST00000419535 528 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AC130472.1-201ENST00000427885 309 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AL121916.1-201ENST00000429405 308 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
FXNQ16595 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
FXNQ16595 LINC01525-201ENST00000442182 511 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
FXNQ16595 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AL583839.2-201ENST00000443716 641 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AC016395.1-201ENST00000444086 465 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
FXNQ16595 PRDX1P1-201ENST00000449329 596 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AC115989.1-202ENST00000452153 1150 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
FXNQ16595 FGF12-AS3-201ENST00000452848 291 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AC092687.2-201ENST00000452909 568 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
FXNQ16595 RANP1-206ENST00000455094 651 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
FXNQ16595 LINC00533-201ENST00000456103 537 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
FXNQ16595 MTND2P28-201ENST00000457540 1044 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AC110749.1-201ENST00000462007 357 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AC093627.1-201ENST00000465755 877 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
FXNQ16595 CFLAR-223ENST00000479953 1230 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AADACP1-204ENST00000483636 1285 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AP005202.1-201ENST00000489915 867 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
FXNQ16595 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
FXNQ16595 AC008967.1-201ENST00000504843 163 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106 ms