Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
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COL4A6Q14031 AC006504.7-201ENST00000592806 924 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
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COL4A6Q14031 AC135983.2-201ENST00000604301 628 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
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COL4A6Q14031 GFPT1-202ENST00000361060 8632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
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COL4A6Q14031 MYOF-201ENST00000358334 6680 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 CARF-202ENST00000402905 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 LINC01527-201ENST00000419578 1997 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
COL4A6Q14031 HMGB4-204ENST00000522796 2505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
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COL4A6Q14031 TAS2R8-201ENST00000240615 1243 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
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