Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 LINC01192-206ENST00000489012 818 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 AC124893.1-201ENST00000496247 545 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 LYRM4-208ENST00000500576 592 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 AP003028.1-203ENST00000525832 444 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 LRTOMT-218ENST00000541614 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 LINC02319-201ENST00000555852 349 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 AL049779.3-201ENST00000557141 606 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 AC022523.1-201ENST00000560360 364 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 AC004232.2-201ENST00000574245 821 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 MIR5010-201ENST00000582846 120 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 AP005136.2-201ENST00000583253 1049 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 AC005726.5-201ENST00000585189 298 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 Z98949.1-228ENST00000595093 798 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 AC022387.2-201ENST00000604050 448 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 AP001823.1-201ENST00000604056 1003 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 AC135983.2-201ENST00000604301 628 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 LINC01435-220ENST00000630847 714 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 AC010325.3-201ENST00000641084 394 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 NRG3-208ENST00000556918 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 ESF1-201ENST00000202816 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 MEIOB-205ENST00000470044 1857 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 GVINP1-201ENST00000526769 8438 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 ENTPD1-AS1-212ENST00000458228 3274 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 STAU2-210ENST00000521210 1950 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 TCF12-214ENST00000559710 1314 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 TRAT1-201ENST00000295756 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 OR11H1-201ENST00000252835 982 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 DPH5-201ENST00000342173 1143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 FPGT-TNNI3K-201ENST00000370893 1195 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 RSL24D1P8-201ENST00000434442 492 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 SMIM30-204ENST00000441359 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 AL356121.1-201ENST00000442911 156 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 CYP3A43-210ENST00000444905 733 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 MTND3P4-201ENST00000453537 303 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 RN7SL552P-201ENST00000462094 276 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 RN7SL352P-201ENST00000466002 277 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 RPL12P30-201ENST00000488389 499 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 KDELR2-206ENST00000490996 655 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 LINC01091-201ENST00000508111 645 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 SNX18P25-201ENST00000510539 758 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 AC090958.1-201ENST00000511122 351 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 NR1I3-229ENST00000511748 480 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 MRPS5P3-201ENST00000515577 166 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 AC083923.2-202ENST00000517773 498 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 H2AFV-208ENST00000521529 439 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 OR9A4-201ENST00000548136 1093 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 OR11H2-201ENST00000556246 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 AC091151.1-201ENST00000587369 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 AC020915.3-201ENST00000595301 550 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 AL161457.2-204ENST00000609241 869 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 Metazoa_SRP.94-201ENST00000612609 250 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 AL354696.1-201ENST00000614652 497 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 AL031658.2-201ENST00000616850 651 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 AC084816.1-204ENST00000628326 631 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 CEP44-206ENST00000503780 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 MLH1-206ENST00000435176 2428 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 FCGR3B-208ENST00000613418 2251 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 IQCM-205ENST00000636414 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 HSFY1P1-202ENST00000425038 1381 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 NCOA3-202ENST00000371998 4668 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 AP002004.1-203ENST00000531091 1768 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 LINC01602-201ENST00000522992 2109 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 BMP10-201ENST00000295379 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 HIPK1-204ENST00000369555 3966 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 TRAV25-201ENST00000390454 403 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 AL139805.1-201ENST00000407837 289 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 RN7SKP144-201ENST00000411108 279 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 FAM183DP-201ENST00000421987 399 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 AC244453.3-201ENST00000426275 459 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 CCNB1IP1P1-201ENST00000428976 839 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CUL4BQ13620 PSMD10P2-201ENST00000432890 672 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
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