Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 SCML2-202ENST00000398048 1334 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 NFIB-204ENST00000380953 2381 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 AC021074.3-201ENST00000476385 1825 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 MECOM-203ENST00000460814 3374 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 RSPO3-202ENST00000368317 1290 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 RBBP4P5-201ENST00000398583 1266 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 AL096800.1-201ENST00000405326 893 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 AC017035.1-201ENST00000411999 1115 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 AL138733.1-201ENST00000415477 853 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 AL160275.1-201ENST00000423632 476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 PRH1-201ENST00000428168 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 AKR1D1-203ENST00000432161 1236 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 AL390879.1-201ENST00000439143 386 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 AL592161.1-201ENST00000456389 861 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 TNS3-209ENST00000458317 1156 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 RN7SL83P-201ENST00000468131 297 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 RPL5P12-201ENST00000477071 851 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 Vault.2-201ENST00000516519 98 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 CASC21-201ENST00000521586 290 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 IGHVIII-11-1-201ENST00000522733 267 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 DEFB134-202ENST00000526438 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 CKS1BP1-201ENST00000555221 240 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 AL161757.3-201ENST00000555316 807 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 AC009396.2-201ENST00000555954 700 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 LINC01146-207ENST00000557339 397 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 AC027176.2-201ENST00000559166 746 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 AC066613.1-201ENST00000559977 1053 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 RPS15A-203ENST00000563390 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 PWRN1-208ENST00000567647 561 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 AL355802.4-201ENST00000607635 548 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 AC244196.4-201ENST00000611787 392 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 MIR6774-201ENST00000614651 70 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 BMS1P14-201ENST00000615056 606 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 CCL15-204ENST00000617897 1073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 AP006248.3-201ENST00000623580 594 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 CTTNBP2NL-201ENST00000271277 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 CNOT6LP1-201ENST00000559681 1462 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 TRMT13-202ENST00000370141 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 ANGPT2-201ENST00000325203 5416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 FOXP2-203ENST00000378237 2187 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 TLR10-208ENST00000622002 3673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 HIPK1-204ENST00000369555 3966 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 AC124312.1-201ENST00000551312 1325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 OCM2-201ENST00000257627 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 TMEM202-201ENST00000341689 1012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 HHLA3-201ENST00000359875 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 AL591503.1-201ENST00000366224 477 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 ATP6V1G3-203ENST00000367382 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 RAB5CP1-201ENST00000395972 580 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 RN7SKP121-201ENST00000410842 305 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 NR1I3-208ENST00000412844 989 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 AF064860.1-201ENST00000416555 544 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 SLC8A1-AS1-202ENST00000417875 344 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 AL135785.1-201ENST00000422554 399 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 AC104463.2-201ENST00000428573 314 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 AC073257.1-201ENST00000432474 523 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 AC073062.1-201ENST00000434509 455 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 GAPDHP23-201ENST00000444823 993 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 AL450345.1-201ENST00000456118 311 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 RN7SL326P-201ENST00000477493 296 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 AC090543.1-201ENST00000492168 485 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 AP001001.1-202ENST00000527594 692 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 AP000753.2-201ENST00000540307 423 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 AC008055.1-201ENST00000547032 609 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 MIR9-3HG-211ENST00000561037 779 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 AC126365.2-201ENST00000580630 379 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 RNU4ATAC-201ENST00000580972 127 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 AC090283.1-201ENST00000582101 265 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 AC004917.1-204ENST00000592441 701 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 SETSIP-202ENST00000596516 909 ntAPPRIS P2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 AC005776.1-201ENST00000603164 290 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 AC242628.1-201ENST00000606810 391 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 LINC01320-206ENST00000607437 528 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 OR51C1P-201ENST00000608504 942 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 AC110792.4-201ENST00000609843 298 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 MIR6070-201ENST00000613967 103 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 UBE2NL-201ENST00000618570 1185 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 AC004160.1-201ENST00000625468 929 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 DRG1-207ENST00000629688 309 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
GPS1Q13098 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
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