Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
TMPOP42166 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
TMPOP42166 CAPSL-201ENST00000397366 969 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TMPOP42166 LSM5-203ENST00000409782 649 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TMPOP42166 MTND6P12-201ENST00000428247 522 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
TMPOP42166 CA1-201ENST00000431316 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TMPOP42166 DEFA9P-201ENST00000433042 285 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
TMPOP42166 RPS3AP38-201ENST00000435889 763 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
TMPOP42166 AL009050.1-201ENST00000445278 426 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TMPOP42166 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TMPOP42166 AC007998.1-201ENST00000474156 672 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
TMPOP42166 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TMPOP42166 GCSAM-204ENST00000484193 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TMPOP42166 AC139720.1-201ENST00000509497 512 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TMPOP42166 VEPH1-219ENST00000537559 992 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TMPOP42166 LINC02411-203ENST00000546180 959 ntTSL 4 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TMPOP42166 AC004551.1-201ENST00000552784 575 ntTSL 4 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TMPOP42166 GNG2-208ENST00000554875 430 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TMPOP42166 AC136944.1-201ENST00000567464 560 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TMPOP42166 U95743.1-201ENST00000573369 1001 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TMPOP42166 AC091151.1-201ENST00000587369 726 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
TMPOP42166 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
TMPOP42166 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
TMPOP42166 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
TMPOP42166 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
TMPOP42166 AP001962.1-201ENST00000624114 559 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
TMPOP42166 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TMPOP42166 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
TMPOP42166 AC092646.2-201ENST00000431242 2095 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
TMPOP42166 SGMS2-203ENST00000394686 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
TMPOP42166 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
TMPOP42166 MEF2C-249ENST00000637481 6088 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TMPOP42166 LRRN3-201ENST00000308478 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
TMPOP42166 AC009404.1-201ENST00000420330 3090 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TMPOP42166 NCOA6-202ENST00000374796 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
TMPOP42166 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TMPOP42166 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TMPOP42166 SLC30A6-201ENST00000282587 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
TMPOP42166 CREB5-201ENST00000357727 8532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
TMPOP42166 KIAA0232-202ENST00000425103 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
TMPOP42166 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TMPOP42166 SORBS1-205ENST00000371227 7279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
TMPOP42166 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TMPOP42166 MLIP-206ENST00000502396 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TMPOP42166 EYA4-206ENST00000431403 2154 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TMPOP42166 NUMB-201ENST00000355058 3342 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TMPOP42166 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TMPOP42166 LSAMP-207ENST00000539563 8821 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TMPOP42166 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TMPOP42166 RN7SKP78-201ENST00000364711 318 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TMPOP42166 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
TMPOP42166 AC127526.2-201ENST00000426436 775 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TMPOP42166 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TMPOP42166 AC099521.1-201ENST00000482557 334 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TMPOP42166 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TMPOP42166 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TMPOP42166 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TMPOP42166 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TMPOP42166 DPPA2P4-201ENST00000563717 878 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TMPOP42166 AC009097.1-201ENST00000567077 406 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TMPOP42166 ADAM3B-201ENST00000569937 840 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TMPOP42166 AL139220.2-221ENST00000628123 395 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TMPOP42166 AL355860.1-201ENST00000636087 1229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TMPOP42166 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TMPOP42166 FBXL21-201ENST00000297158 1305 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
TMPOP42166 TRIM64-201ENST00000533122 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
TMPOP42166 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TMPOP42166 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
TMPOP42166 CSMD2-206ENST00000373388 13118 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
TMPOP42166 RALYL-211ENST00000523850 1684 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TMPOP42166 MPDZ-202ENST00000319217 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TMPOP42166 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
TMPOP42166 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
TMPOP42166 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
TMPOP42166 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
TMPOP42166 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
TMPOP42166 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
TMPOP42166 FUNDC2P3-201ENST00000334716 533 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TMPOP42166 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TMPOP42166 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TMPOP42166 AL357752.1-201ENST00000412817 349 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TMPOP42166 AC092687.1-201ENST00000418835 389 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TMPOP42166 BIRC6-201ENST00000421745 15703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
TMPOP42166 AL008723.2-201ENST00000426354 562 ntTSL 4 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TMPOP42166 MAPKAPK5P1-201ENST00000431810 1376 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TMPOP42166 UBE2L5P-201ENST00000436446 465 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TMPOP42166 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TMPOP42166 SUMO2P3-201ENST00000438311 288 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TMPOP42166 CCDC26-201ENST00000446592 1721 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
TMPOP42166 OSTCP1-201ENST00000455507 450 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TMPOP42166 AC112495.1-201ENST00000456037 756 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TMPOP42166 RNF19BPY-201ENST00000458209 1550 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TMPOP42166 RPSAP37-201ENST00000470913 821 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TMPOP42166 ZNF480-204ENST00000490272 2238 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TMPOP42166 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TMPOP42166 ZNF840P-201ENST00000504759 1996 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TMPOP42166 AC106872.5-201ENST00000508856 1416 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TMPOP42166 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
TMPOP42166 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
TMPOP42166 C15orf41-204ENST00000562877 764 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.9 ms