Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 NLRC4-204ENST00000404025 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 RNU6-1331P-201ENST00000363658 106 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 SNORA70G-201ENST00000383923 142 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 SDHC-203ENST00000392169 369 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 CDKL4-202ENST00000395035 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 HMGB1P10-201ENST00000395823 563 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 FDPSP5-201ENST00000399474 1057 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AL033519.1-201ENST00000407266 307 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 RN7SKP205-201ENST00000410999 307 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 RN7SKP273-201ENST00000411392 314 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 BX119321.1-201ENST00000428912 797 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AC128677.1-201ENST00000436016 442 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 Z98949.3-201ENST00000436423 472 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 Z74696.2-201ENST00000436514 498 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AC096632.2-201ENST00000438139 1239 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AL031681.1-201ENST00000443304 400 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AC005297.1-201ENST00000444765 862 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AL590004.3-202ENST00000445883 451 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 OSBPL10-AS1-206ENST00000447181 575 ntTSL 4 BASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AC115989.1-202ENST00000452153 1150 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 RPL7L1P3-201ENST00000455249 689 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AC022441.2-201ENST00000514113 382 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 TPRXL-210ENST00000532753 478 ntTSL 4 BASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 OR4A6P-201ENST00000534364 970 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 PSMA6-204ENST00000553809 879 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AC016526.1-201ENST00000555465 520 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 PSMA6-214ENST00000556506 763 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AC006305.3-201ENST00000590589 454 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 KCNMA1-AS1-204ENST00000595702 504 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AC007255.2-201ENST00000604053 631 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AP002360.3-201ENST00000607673 710 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AC105227.2-201ENST00000615075 605 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AL359757.1-201ENST00000623176 255 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AL161457.2-202ENST00000629161 743 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 LINC01141-204ENST00000635564 1008 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AC007603.3-201ENST00000636915 979 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 PPARA-201ENST00000262735 9965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 LMO7-205ENST00000377534 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 FBXW7-201ENST00000263981 3743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 ETS1-202ENST00000392668 5139 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 FAM186A-201ENST00000327337 7127 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 TXNIP-204ENST00000582401 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 FLJ21408-201ENST00000499939 2594 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 SLC16A4-210ENST00000541986 2496 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 INTS7-202ENST00000366993 3422 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 GOLGB1-209ENST00000614479 11115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AMOT-204ENST00000371962 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 LMO7-207ENST00000465261 5580 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 VRK2-203ENST00000417641 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 FANCD2P2-201ENST00000437591 1400 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 THAP9-201ENST00000302236 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 RALYL-211ENST00000523850 1684 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 FTO-222ENST00000637969 2889 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 LYPD6B-202ENST00000409029 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AL512329.1-201ENST00000404600 1592 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 LINC00536-201ENST00000505156 2692 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 CASR-205ENST00000639785 10047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AXDND1-214ENST00000617277 3405 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 CELF2-203ENST00000416382 6894 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AC008937.3-201ENST00000606813 1700 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 HIPK1-211ENST00000626993 8016 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 CDADC1-201ENST00000251108 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 RAD54B-201ENST00000297592 1879 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 ZMYND8-206ENST00000372023 5144 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 FGD6-205ENST00000549499 3757 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AC011379.1-201ENST00000508713 3025 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 NUMB-223ENST00000556772 5172 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 GDPD4-201ENST00000315938 2533 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 ODF2L-203ENST00000359242 7560 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 CCL20-201ENST00000358813 800 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 RNA5SP172-201ENST00000365061 118 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 FABP3-201ENST00000373713 725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 TRAV13-1-201ENST00000390436 360 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AL133260.1-201ENST00000405720 405 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 RNU2-17P-201ENST00000410290 190 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 RN7SKP263-201ENST00000411194 309 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 GRIK1-AS1-202ENST00000412579 818 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AC004074.1-201ENST00000421810 1063 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AL591178.2-201ENST00000429191 461 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 KRTAP3-4P-201ENST00000430780 280 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 GAPDHP19-201ENST00000431768 1005 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
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