Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 TMC7-202ENST00000421369 4499 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 FAM221B-203ENST00000423537 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 EPS15-203ENST00000371733 5225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 LRRC37A16P-202ENST00000586022 3725 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 OR2A2-201ENST00000408979 1051 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 METTL5-205ENST00000409837 936 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 Z68694.1-201ENST00000413929 841 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 ARAFP1-201ENST00000422172 605 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
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USP18Q9UMW8 AL354824.1-201ENST00000424931 349 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 RNF19BPX-201ENST00000426224 625 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 AC024601.1-201ENST00000427247 524 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 GAPDHP59-201ENST00000435908 267 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 ATP6V1G1P4-201ENST00000438388 335 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 DNAJA1P5-201ENST00000440278 943 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 AL139161.1-201ENST00000443207 190 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 AL590399.3-202ENST00000448491 495 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
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USP18Q9UMW8 AC005304.1-201ENST00000457609 405 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 AL122019.1-202ENST00000458070 546 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
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USP18Q9UMW8 VAMP3-202ENST00000470357 954 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 H3F3AP5-201ENST00000475267 429 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 AC091874.2-201ENST00000505889 720 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 TAS2R50-201ENST00000506868 1000 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 C8orf22-203ENST00000517663 788 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 AP003355.1-201ENST00000518956 587 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 AC010609.1-201ENST00000519375 569 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 AC008662.1-201ENST00000521805 674 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 LINC02420-201ENST00000543387 741 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 AL162632.2-201ENST00000553933 399 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 AC013652.2-202ENST00000558948 910 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 SLC25A3P1-203ENST00000563752 460 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 AC009852.1-201ENST00000564058 465 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
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USP18Q9UMW8 AC233266.2-201ENST00000567067 528 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 AC090518.1-202ENST00000568246 578 ntTSL 4 BASIC6.89□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 MRPS21P9-201ENST00000571150 257 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 AL354740.1-205ENST00000586413 1230 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 RPL29P33-201ENST00000587474 316 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 APOC2-203ENST00000590360 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
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USP18Q9UMW8 AC097467.4-201ENST00000605504 141 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 ERC2-214ENST00000612797 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
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USP18Q9UMW8 MMP2-AS1-203ENST00000620495 625 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 PCBP1-AS1-360ENST00000630377 598 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 LINC01440-201ENST00000416190 1340 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
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USP18Q9UMW8 ELMOD2-201ENST00000323570 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
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USP18Q9UMW8 AL359694.2-201ENST00000567753 1615 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 KCNJ1-203ENST00000392664 1674 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
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USP18Q9UMW8 VEGFD-201ENST00000297904 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
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USP18Q9UMW8 OR52B5P-204ENST00000641744 3467 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
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USP18Q9UMW8 FGFR2-218ENST00000478859 3990 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 C1orf27-202ENST00000367470 3754 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 XRCC5-201ENST00000392132 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
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USP18Q9UMW8 IL2RA-203ENST00000379959 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
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USP18Q9UMW8 CDON-202ENST00000392693 9138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 AC005332.9-201ENST00000620266 2921 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
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USP18Q9UMW8 IL31RA-201ENST00000297015 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 RAP1GDS1-204ENST00000408900 1942 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 SYT14-207ENST00000629778 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 AC010168.2-201ENST00000562691 5428 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 PPP1R11-201ENST00000376758 1723 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 MTCO1P11-201ENST00000429111 1528 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 CLEC12A-205ENST00000434319 1515 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 EIF1AY-201ENST00000361365 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 LRRC37A15P-201ENST00000514785 1355 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 SORCS1-209ENST00000612154 6862 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 LGALS8-222ENST00000527974 1349 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 CCR8-201ENST00000326306 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 ARGFX-201ENST00000334384 992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 PLAC1-201ENST00000359237 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 RNA5SP485-201ENST00000365053 119 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 AC087276.2-201ENST00000394183 183 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 AC084816.1-201ENST00000413794 565 ntTSL 4 BASIC6.88□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 IPPKP1-201ENST00000422501 768 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 AL358394.1-201ENST00000422807 535 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 AP000855.1-201ENST00000433210 636 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 ARL5AP3-201ENST00000439327 386 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 Z99127.2-201ENST00000441426 334 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 AL354793.1-201ENST00000446028 713 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 AL122008.4-201ENST00000446433 388 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 RPL23AP64-201ENST00000469465 435 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
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