Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 AP003049.2-201ENST00000532992 540 ntTSL 4 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 SAA3P-201ENST00000533267 365 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 LINC02407-202ENST00000553247 1083 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 AL354733.2-210ENST00000586211 647 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 NUTM2B-AS1-209ENST00000596088 366 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 OR7A18P-201ENST00000600416 277 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 MARK3P1-201ENST00000604796 643 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 AC093635.1-201ENST00000609028 555 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 TEX41-256ENST00000626411 368 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 AC087565.3-203ENST00000641018 837 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 OR9K2-204ENST00000641374 1122 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 HMG20A-202ENST00000381714 4112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 CASP10-201ENST00000272879 2073 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 AC114401.1-201ENST00000484222 2084 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 ZNF19-206ENST00000565100 2087 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 CCNB3-204ENST00000376042 4693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 PMCHL2-201ENST00000415808 1841 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 HDAC9-202ENST00000405010 4239 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 AL512604.2-201ENST00000426946 1314 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 FGF13-201ENST00000305414 1939 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 PPP6C-201ENST00000373547 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 AC106800.1-201ENST00000501221 1362 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 AC122713.2-201ENST00000624942 3335 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 PPP2R3A-201ENST00000264977 6795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 MGAM-208ENST00000549489 6525 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 AC092821.2-201ENST00000545710 2042 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 EIF1-203ENST00000469257 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 ARF4-209ENST00000496292 1467 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 TROVE2-201ENST00000367441 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 DMC1-203ENST00000428462 2082 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 OR4F15-201ENST00000332238 2119 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 CLEC12A-201ENST00000304361 1549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 MIR4435-2HG-207ENST00000439362 1522 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 ADAM7-204ENST00000520720 1870 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 LINC02532-208ENST00000602621 2232 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 IMPA1-202ENST00000311489 1106 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 PIH1D3-201ENST00000336387 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 ATF3-204ENST00000366983 858 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 C9orf92-202ENST00000380685 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 RPL5P35-201ENST00000398869 816 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 SLC8A1-AS1-201ENST00000413479 800 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 LINC01709-201ENST00000415532 634 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 HLA-DQB1-AS1-201ENST00000419852 552 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 LINC02020-202ENST00000421006 575 ntTSL 4 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 AC018467.1-202ENST00000432612 533 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 RPSAP32-201ENST00000432681 526 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 AC008072.1-201ENST00000434254 824 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 SEPHS1P4-201ENST00000446112 1176 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 AC011005.4-201ENST00000466717 535 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 RPL5P17-201ENST00000469685 877 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 AC005550.2-201ENST00000476382 318 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 RN7SL332P-201ENST00000482163 254 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 TMEM196-205ENST00000493519 687 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 LINC02161-201ENST00000503691 420 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 AC091175.1-201ENST00000522168 572 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 TPT1-AS1-216ENST00000522845 403 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 AC114550.3-201ENST00000524073 579 ntTSL 4 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 OR8Q1P-201ENST00000526467 655 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 AC078950.1-204ENST00000540635 523 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 AC009997.1-201ENST00000557862 129 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 DPPA2P4-201ENST00000563717 878 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 AC009101.1-201ENST00000568135 242 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 C17orf80-208ENST00000582793 531 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 AC005537.1-201ENST00000588324 1238 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 UBE2E3-208ENST00000602632 446 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 TMEM55A-206ENST00000630164 171 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 SMG7-216ENST00000638826 219 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 ZNF85-202ENST00000328178 2296 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 ADAM3A-207ENST00000490268 2627 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 PRLR-203ENST00000348262 1339 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 NUMB-201ENST00000355058 3342 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 USP9X-201ENST00000324545 12401 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 ZNF680-201ENST00000309683 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PHACTR1Q9C0D0 CNTNAP4-206ENST00000478060 3708 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
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