Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 AL031601.1-201ENST00000605702 394 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CCDC93Q567U6 AL021707.7-201ENST00000607991 416 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CCDC93Q567U6 FOXJ3-209ENST00000545068 5165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CCDC93Q567U6 SORCS1-210ENST00000622431 6701 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CCDC93Q567U6 AC010328.1-201ENST00000596769 4060 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CCDC93Q567U6 AC053481.2-202ENST00000582394 1500 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CCDC93Q567U6 NBPF12-205ENST00000617614 4630 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CCDC93Q567U6 ZNF542P-202ENST00000467807 3209 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
CCDC93Q567U6 LINC02153-202ENST00000522604 1644 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CCDC93Q567U6 CMAHP-202ENST00000377993 1681 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
CCDC93Q567U6 AC062022.1-201ENST00000451026 1684 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CCDC93Q567U6 AL355377.1-201ENST00000621125 1653 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CCDC93Q567U6 FAM208A-210ENST00000614531 3441 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
CCDC93Q567U6 FAR2-201ENST00000182377 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
CCDC93Q567U6 EXPH5-203ENST00000525344 6542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC93Q567U6 FOXM1-202ENST00000359843 3315 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC93Q567U6 BTN3A2-203ENST00000396934 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC93Q567U6 NF1-202ENST00000358273 12425 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC93Q567U6 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC93Q567U6 CNIH1-201ENST00000216416 4793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC93Q567U6 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC93Q567U6 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC93Q567U6 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC93Q567U6 RNU6-316P-201ENST00000391027 107 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC93Q567U6 SGMS2-203ENST00000394686 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC93Q567U6 TMEM209-201ENST00000397622 3545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC93Q567U6 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC93Q567U6 MIR541-201ENST00000401360 84 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC93Q567U6 ABCB5-203ENST00000406935 1483 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC93Q567U6 SLC19A3-202ENST00000409287 644 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC93Q567U6 KIF27-204ENST00000413982 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC93Q567U6 FLJ27354-201ENST00000415584 788 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC93Q567U6 AC009404.1-201ENST00000420330 3090 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC93Q567U6 MEPE-203ENST00000424957 2022 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC93Q567U6 AL590723.1-201ENST00000426030 629 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC93Q567U6 AC244033.1-201ENST00000426826 870 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC93Q567U6 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC93Q567U6 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC93Q567U6 AK3P5-201ENST00000432033 519 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC93Q567U6 DHRS9-205ENST00000432060 1652 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC93Q567U6 MORF4-201ENST00000447135 971 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC93Q567U6 OSBPL9-205ENST00000447887 2940 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC93Q567U6 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC93Q567U6 PRB1-202ENST00000500254 775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC93Q567U6 AC091965.3-201ENST00000506236 208 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC93Q567U6 AC131182.1-201ENST00000509184 657 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC93Q567U6 AC010609.1-201ENST00000519375 569 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC93Q567U6 CASC21-201ENST00000521586 290 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC93Q567U6 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC93Q567U6 CLEC2B-202ENST00000538152 745 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC93Q567U6 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC93Q567U6 GNG2-208ENST00000554875 430 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
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CCDC93Q567U6 TM6SF1-207ENST00000565774 1020 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
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CCDC93Q567U6 UBA52-209ENST00000597451 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
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CCDC93Q567U6 AC073592.7-201ENST00000623659 507 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CCDC93Q567U6 RNF213-220ENST00000582970 21055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
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CCDC93Q567U6 C14orf105-201ENST00000216445 3082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 CCDC190-202ENST00000367911 1395 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
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CCDC93Q567U6 AL512310.3-201ENST00000547023 1335 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 NCAPG2-202ENST00000409339 5253 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 ADTRP-201ENST00000229583 891 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 TRIM60P16-201ENST00000444048 694 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 SBDSP1-204ENST00000453858 737 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 AC094108.1-201ENST00000502494 527 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 AC108727.2-201ENST00000512277 392 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 OR5D2P-201ENST00000524390 911 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 AC138123.2-201ENST00000550324 579 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 AC020978.2-201ENST00000563203 428 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 AC090651.1-201ENST00000567865 634 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 AC023932.1-201ENST00000582726 429 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 AC107993.1-201ENST00000591343 684 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 AP000864.1-201ENST00000609424 650 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 TXNRD1-205ENST00000503506 3930 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 SLC35F1-202ENST00000621341 4481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 JAKMIP2-205ENST00000507386 5915 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 AC005618.1-201ENST00000606901 3148 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 TTLL5-217ENST00000556893 3071 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 NBPF9-205ENST00000613595 4527 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 AKAP7-201ENST00000263050 2238 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 OR12D2-207ENST00000642051 1496 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 KIAA1549L-202ENST00000321505 11678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CCDC93Q567U6 AC022325.1-201ENST00000502748 2199 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
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