Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 GLYATL1P2-201ENST00000529451 510 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 OR5F2P-201ENST00000532761 941 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 HNRNPA1P71-201ENST00000559135 950 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AC002310.3-201ENST00000569728 723 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 LINC01572-204ENST00000570035 831 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AL031722.1-201ENST00000570247 220 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AC139099.3-202ENST00000574856 439 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 SKA2-203ENST00000578105 689 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 SLC14A1-214ENST00000589700 1022 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AC072062.1-205ENST00000595058 962 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AC010605.1-201ENST00000597303 797 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AC073530.2-201ENST00000623987 261 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 PCBP1-AS1-360ENST00000630377 598 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 KLHL5-201ENST00000261425 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 LIN7A-204ENST00000552864 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 GPRIN3-201ENST00000333209 6260 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 C3orf30-201ENST00000295622 1814 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 HAUS3-201ENST00000243706 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 DCN-204ENST00000425043 1438 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 WNK1-220ENST00000574564 1401 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 UEVLD-205ENST00000396197 4156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 BDNF-209ENST00000420794 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 CCRL2-201ENST00000357392 1593 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 PKIA-201ENST00000352966 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AC104066.2-201ENST00000564513 1741 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 SYNE2-216ENST00000555002 11532 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 TMEM267-202ENST00000500337 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 NEMP2-202ENST00000409150 6168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 CYLD-210ENST00000566206 3104 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 PNPLA4-204ENST00000537427 2559 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 PAK5-201ENST00000353224 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 SLC8A3-208ENST00000533541 3409 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 APOL4-212ENST00000616056 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 C2orf16-201ENST00000408964 6200 ntAPPRIS P2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 HSP90AB7P-201ENST00000450068 2454 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 MKL2-209ENST00000574045 3309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AL049647.1-201ENST00000319682 1789 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 KARSP1-201ENST00000451871 1752 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 CFI-205ENST00000512148 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 ZNF549-204ENST00000602149 5505 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 CNKSR3-205ENST00000607772 21063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 OPALIN-203ENST00000393871 3545 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AC036214.3-201ENST00000522938 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AL390726.6-201ENST00000637760 1654 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 DYRK1A-201ENST00000338785 5498 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 FRMD7-203ENST00000464296 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 CTAGE3P-201ENST00000454280 2404 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 KLHL2-209ENST00000514860 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 FAM227A-205ENST00000535113 10322 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AC007068.1-201ENST00000396690 844 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 SNORA77.2-201ENST00000408571 112 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 CLK1-203ENST00000409769 1192 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 RN7SKP129-201ENST00000410288 299 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 RN7SKP207-201ENST00000411204 303 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 ICA1L-206ENST00000418208 602 ntTSL 4 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AC010145.1-201ENST00000422415 516 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 FAM221B-203ENST00000423537 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 CHCHD3P1-201ENST00000425516 676 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 CUBNP2-201ENST00000443534 1139 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AL161937.1-202ENST00000451960 341 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AC234781.3-201ENST00000452540 973 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 HNRNPDLP2-201ENST00000455248 751 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 RN7SL88P-201ENST00000480166 299 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 PHC3-208ENST00000481639 1075 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AC105924.1-201ENST00000504057 339 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AC005699.1-204ENST00000509244 747 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 SCARNA6-201ENST00000515982 265 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AC027308.1-201ENST00000517993 110 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 PTS-202ENST00000524931 696 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AC084125.1-201ENST00000525461 429 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 EPB41L2-228ENST00000531410 2926 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 ZADH2-202ENST00000537114 3205 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 LINC02468-201ENST00000543778 633 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 NACA-216ENST00000550952 2922 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AC023161.2-201ENST00000551218 780 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AC007424.1-205ENST00000552615 579 ntTSL 4 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 PSMA6-204ENST00000553809 879 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AC013652.2-202ENST00000558948 910 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 LINS1-207ENST00000560133 1196 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 PPIAL4A-201ENST00000577856 660 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 DPRXP4-201ENST00000578053 568 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AC243756.1-201ENST00000584068 660 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 RPL29P33-201ENST00000587474 316 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CCDC85BQ15834 AC011444.3-201ENST00000588342 325 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms