Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AC096537.2-201ENST00000413707 714 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 GSTA6P-201ENST00000424144 582 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AC073062.1-201ENST00000434509 455 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AC026367.2-201ENST00000610630 553 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AL356752.1-201ENST00000615844 593 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 ERG-208ENST00000417133 5023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 PLCH1-206ENST00000494598 3525 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 PLD5-208ENST00000536534 8721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 ACPP-201ENST00000336375 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 OPA3-201ENST00000263275 7828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 TXLNB-201ENST00000358430 4753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 RPE65-201ENST00000262340 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 LUC7L2-201ENST00000263545 2287 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 ERG-204ENST00000398907 4809 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 LINC01588-202ENST00000528300 3208 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 NCOA1-204ENST00000405141 7405 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 TMEM200A-203ENST00000545622 2918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 NUP98-202ENST00000355260 5628 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 PLEC-204ENST00000354958 14751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AC017079.1-201ENST00000333650 415 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 FRMPD4-AS1-201ENST00000425057 285 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AC023141.6-201ENST00000429418 337 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 RPS3AP38-201ENST00000435889 763 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 REG1CP-206ENST00000447469 496 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 PRELID3BP6-201ENST00000503839 571 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AC091979.1-201ENST00000517595 706 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 GCSHP4-201ENST00000538792 439 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 LINC02520-201ENST00000570443 537 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AC130456.6-201ENST00000623745 765 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 EIF4A2-205ENST00000440191 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 ZC3H13-202ENST00000282007 6412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 MGAT5-202ENST00000409645 8252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 SETD5-204ENST00000406341 6582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 ABCC4-201ENST00000376887 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 LONP2-201ENST00000285737 8199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 MCC-201ENST00000302475 8257 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 TTLL5-207ENST00000554510 2624 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 CCDC88A-207ENST00000436346 9811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 NRCAM-204ENST00000379028 6685 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 TRPC5-201ENST00000262839 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 DSTYK-201ENST00000367161 7739 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 MSL3-206ENST00000380693 2377 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 TEP1-209ENST00000556935 7643 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 PRDM15-203ENST00000422911 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 OR11H13P-201ENST00000359695 979 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AL451047.1-201ENST00000424451 814 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 LINC02059-201ENST00000503843 452 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 KRT73-AS1-203ENST00000552364 3808 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
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HERC1Q15751 AC034229.6-201ENST00000623704 224 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AL157778.1-201ENST00000626665 729 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 PTPRR-202ENST00000342084 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
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HERC1Q15751 LINC01440-201ENST00000416190 1340 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
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HERC1Q15751 KDM5B-203ENST00000367265 10345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 PCDHA10-203ENST00000562220 12358 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 ADGRG6-203ENST00000367608 6879 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 MEG3-220ENST00000522771 6984 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 PAN2-202ENST00000425394 5372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 LNPK-201ENST00000272748 7610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 TMEM167A-201ENST00000502346 4630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AL442071.1-201ENST00000289890 558 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 MYRFL-201ENST00000299350 820 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AC087276.2-201ENST00000394183 183 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AC000124.1-201ENST00000448311 957 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 RPL7AP52-201ENST00000458096 790 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AC087672.1-201ENST00000479876 766 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AC084768.1-201ENST00000518926 923 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 NRG3-205ENST00000537893 1174 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 ZNF735-201ENST00000429565 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 AC017104.4-201ENST00000636283 1592 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC1Q15751 MAPK10-377ENST00000642006 2752 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
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