Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 LINC01952-202ENST00000450016 281 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 MLF1-205ENST00000469452 1098 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 RABGAP1L-214ENST00000478442 648 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 RNA5SP271-201ENST00000516700 88 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 UQCRB-204ENST00000518406 595 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 AC090103.1-201ENST00000520386 485 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 AC062004.1-202ENST00000524014 246 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 AC110056.1-201ENST00000525759 911 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
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ITGB3BPQ13352 AC004551.1-201ENST00000552784 575 ntTSL 4 BASIC6.78□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 AL132800.1-201ENST00000555109 698 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 LINC00929-203ENST00000556213 713 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 AC130371.1-201ENST00000577023 230 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
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ITGB3BPQ13352 AC005899.5-201ENST00000584721 552 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
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ITGB3BPQ13352 SNHG8-202ENST00000602483 309 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 AC027334.1-201ENST00000603257 310 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 AC100767.2-201ENST00000604840 693 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 Xist_exon4.1-201ENST00000615964 126 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 AC005154.1-203ENST00000626245 451 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 AC004852.2-201ENST00000614289 2218 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 RTL9-203ENST00000540313 5225 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 MLLT10-217ENST00000631589 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
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ITGB3BPQ13352 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
ITGB3BPQ13352 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
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ITGB3BPQ13352 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 KCNJ15-201ENST00000328656 8399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 AC087258.1-203ENST00000545400 1629 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
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ITGB3BPQ13352 RNA5SP122-201ENST00000384457 108 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
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ITGB3BPQ13352 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 PQLC2L-202ENST00000426338 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 HNRNPA1P18-201ENST00000433537 927 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 TRGC2-201ENST00000436911 1013 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 AF130359.1-201ENST00000444868 438 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 SLC25A51P1-201ENST00000468432 871 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
ITGB3BPQ13352 AC023245.1-201ENST00000468501 517 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
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