Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 AL731556.1-201ENST00000394628 3711 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 SEC61A2-202ENST00000304267 2030 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 KIAA2012-205ENST00000541917 3543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 ANAPC10-201ENST00000309439 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 F9-202ENST00000394090 1272 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 SNX24-202ENST00000395451 1050 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 U3.43-201ENST00000410734 213 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 AL122019.1-202ENST00000458070 546 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 LSM3P4-201ENST00000502948 309 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 AC025458.1-201ENST00000506046 166 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 LINC02512-201ENST00000509548 429 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 AC084337.1-201ENST00000524809 686 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 HNRNPRP2-201ENST00000528421 743 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 AP005436.1-201ENST00000531454 488 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 MS4A3-208ENST00000534744 507 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 NANOGNBP2-201ENST00000544753 553 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 VPS29-210ENST00000552130 1057 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 AC009087.1-201ENST00000561827 369 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 AC018558.1-201ENST00000562591 459 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 AC009054.1-201ENST00000568140 427 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 LINC01908-201ENST00000583148 555 ntTSL 4 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 AL591167.1-201ENST00000607321 456 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 AC005225.5-201ENST00000623547 2225 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 GRAMD1C-208ENST00000472026 1876 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 FANCD2-205ENST00000431693 2450 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 SLAMF6-203ENST00000368059 2743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 FAR2-201ENST00000182377 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 OR6C75-202ENST00000641576 4569 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 CHN1-204ENST00000409597 1445 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 AKAP7-201ENST00000263050 2238 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 ZNF184-202ENST00000377419 2899 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 LINC02097-201ENST00000419257 2063 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 RNA5SP188-201ENST00000362916 129 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 SPRR2B-201ENST00000368755 617 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 OR2W1-201ENST00000377175 1028 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 AC092642.1-201ENST00000392417 425 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 AL132875.1-201ENST00000403623 949 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 AC096669.1-201ENST00000422203 648 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 Z99289.1-206ENST00000425503 393 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 AL133329.1-201ENST00000437466 478 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 AC108941.2-201ENST00000506796 716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 AC008705.1-201ENST00000518837 489 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 AP002370.2-201ENST00000531424 545 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 DCN-209ENST00000546745 1026 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 NPIPB1P-201ENST00000547442 1129 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 AC123567.2-202ENST00000550759 446 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 AC089998.2-201ENST00000551856 277 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 C16orf97-205ENST00000568524 406 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 TVP23B-209ENST00000581733 1258 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 AP000919.1-201ENST00000582850 985 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 AC012313.4-201ENST00000596296 495 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 AC012370.2-201ENST00000597541 1080 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 AC024884.1-201ENST00000620583 399 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 OXSM-209ENST00000626005 309 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 ZNF578-201ENST00000421239 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 AL390726.6-201ENST00000637760 1654 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 FAM216B-202ENST00000537894 3300 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 AL157831.2-201ENST00000564681 3095 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 SYT14-207ENST00000629778 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 CR1-201ENST00000367049 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 AC009804.2-201ENST00000637566 3032 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 ACOD1-202ENST00000449753 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 AP002001.1-201ENST00000526101 1759 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 AC009404.1-201ENST00000420330 3090 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 RNU1-134P-201ENST00000362935 165 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 AL050335.1-201ENST00000396909 869 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 HMGN1P20-201ENST00000411849 300 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 AC130360.1-201ENST00000425489 1117 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 AL512641.1-201ENST00000427232 548 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 AL133465.1-201ENST00000432942 512 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 PPIAP10-201ENST00000438675 458 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 AL139275.1-201ENST00000447315 824 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 OR52Y1P-201ENST00000452418 828 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 AC013549.1-201ENST00000454086 566 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 OR2A3P-201ENST00000493774 953 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 AC106864.2-201ENST00000505632 740 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 C5orf64-204ENST00000507461 535 ntTSL 4 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 CR383658.1-201ENST00000514609 734 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 AC090150.1-201ENST00000521408 585 ntTSL 4 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 AC130365.2-201ENST00000525882 1201 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
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