Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 RN7SKP70-201ENST00000516655 271 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
AP3M2P53677 LINC00589-202ENST00000518623 938 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
AP3M2P53677 AC109466.1-215ENST00000519750 516 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
AP3M2P53677 AL671883.2-201ENST00000539514 536 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
AP3M2P53677 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
AP3M2P53677 AC005244.1-201ENST00000582566 339 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
AP3M2P53677 RMDN2-AS1-203ENST00000601029 613 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
AP3M2P53677 AC091167.5-201ENST00000605689 894 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
AP3M2P53677 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
AP3M2P53677 AL136097.3-201ENST00000611097 505 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
AP3M2P53677 SSX4B-202ENST00000619890 1092 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
AP3M2P53677 SSX4-202ENST00000620320 1092 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
AP3M2P53677 CUZD1-205ENST00000368904 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
AP3M2P53677 ZNF311-203ENST00000377179 2730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
AP3M2P53677 AL136985.3-202ENST00000636386 2708 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
AP3M2P53677 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
AP3M2P53677 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
AP3M2P53677 AC092724.1-201ENST00000624623 3397 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
AP3M2P53677 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
AP3M2P53677 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
AP3M2P53677 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
AP3M2P53677 GPR89A-213ENST00000534502 1644 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
AP3M2P53677 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
AP3M2P53677 CCDC125-202ENST00000396496 4198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
AP3M2P53677 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
AP3M2P53677 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
AP3M2P53677 DMD-228ENST00000541735 7080 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
AP3M2P53677 AP004289.1-201ENST00000436307 2205 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
AP3M2P53677 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
AP3M2P53677 PAICS-201ENST00000264221 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
AP3M2P53677 NBPF11-204ENST00000614785 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
AP3M2P53677 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
AP3M2P53677 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
AP3M2P53677 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
AP3M2P53677 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
AP3M2P53677 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
AP3M2P53677 AL096800.1-201ENST00000405326 893 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
AP3M2P53677 AC069277.1-205ENST00000432743 630 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
AP3M2P53677 AC069154.1-201ENST00000432914 542 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
AP3M2P53677 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
AP3M2P53677 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
AP3M2P53677 AC006019.3-201ENST00000446335 698 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
AP3M2P53677 AC104164.1-201ENST00000460282 590 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
AP3M2P53677 SLC25A51P1-201ENST00000468432 871 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
AP3M2P53677 RN7SL170P-201ENST00000487098 295 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
AP3M2P53677 AC092666.1-203ENST00000495144 698 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
AP3M2P53677 LINC02218-202ENST00000504998 582 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
AP3M2P53677 AC108727.2-201ENST00000512277 392 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
AP3M2P53677 OR52B2-201ENST00000530810 1079 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
AP3M2P53677 ALG9-IT1-201ENST00000531305 684 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
AP3M2P53677 AC007956.1-201ENST00000555623 542 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
AP3M2P53677 AL135838.1-201ENST00000556080 235 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
AP3M2P53677 AC009167.1-201ENST00000568317 579 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
AP3M2P53677 AC136443.4-201ENST00000568759 579 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
AP3M2P53677 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
AP3M2P53677 AC011478.1-201ENST00000593140 554 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
AP3M2P53677 AC010320.2-201ENST00000593857 551 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
AP3M2P53677 AL138900.3-201ENST00000607010 629 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
AP3M2P53677 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
AP3M2P53677 GIGYF2-246ENST00000629305 7878 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
AP3M2P53677 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
AP3M2P53677 ZNF528-203ENST00000391788 4209 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
AP3M2P53677 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
AP3M2P53677 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
AP3M2P53677 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
AP3M2P53677 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
AP3M2P53677 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
AP3M2P53677 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
AP3M2P53677 TAF12-202ENST00000373824 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
AP3M2P53677 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
AP3M2P53677 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
AP3M2P53677 AL137058.3-201ENST00000624531 3099 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
AP3M2P53677 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
AP3M2P53677 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
AP3M2P53677 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
AP3M2P53677 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
AP3M2P53677 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
AP3M2P53677 ZNF184-202ENST00000377419 2899 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
AP3M2P53677 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
AP3M2P53677 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
AP3M2P53677 CTTNBP2NL-201ENST00000271277 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
AP3M2P53677 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
AP3M2P53677 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
AP3M2P53677 OR5P2-201ENST00000329434 1069 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
AP3M2P53677 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
AP3M2P53677 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
AP3M2P53677 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
AP3M2P53677 ICA1L-210ENST00000425178 879 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
AP3M2P53677 AL162408.1-201ENST00000428853 433 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
AP3M2P53677 AL365220.1-201ENST00000432923 399 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
AP3M2P53677 AP000295.1-201ENST00000433395 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
AP3M2P53677 ATP5LP2-201ENST00000440646 311 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
AP3M2P53677 HRAT17-202ENST00000451962 687 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
AP3M2P53677 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
AP3M2P53677 AC239584.1-201ENST00000510419 732 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
AP3M2P53677 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
AP3M2P53677 SCARNA18.1-201ENST00000516330 83 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
AP3M2P53677 AC008601.1-201ENST00000519892 527 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
AP3M2P53677 AC090155.1-201ENST00000520800 407 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
AP3M2P53677 AC091185.1-201ENST00000523840 528 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms