Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 AC004801.6-201ENST00000616571 978 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 ELSPBP1-206ENST00000619003 893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 AC073593.1-201ENST00000624500 411 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 AL357562.1-201ENST00000624911 609 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 PRKCH-228ENST00000640011 285 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 ARHGAP29-201ENST00000260526 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 TMED3-202ENST00000424155 16555 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 FLJ12825-201ENST00000515617 3942 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 AC090220.1-201ENST00000593078 1699 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 EOGT-208ENST00000540764 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 RBPJP7-201ENST00000442803 1447 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 RBPJP5-201ENST00000449433 1447 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 AC093225.1-201ENST00000506867 1408 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 AL162726.3-201ENST00000637606 1301 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 KRTAP3-1-201ENST00000391588 594 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 RNA5SP431-201ENST00000410312 120 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 RNU2-18P-201ENST00000411224 162 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 AC022173.1-201ENST00000418554 577 ntTSL 4 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 AC211433.1-202ENST00000434256 1187 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 AL021937.3-201ENST00000446543 361 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 AL445687.2-201ENST00000458156 728 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 AC098847.1-201ENST00000473094 348 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 RBBP4P1-201ENST00000502424 1276 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 SERF1B-203ENST00000503931 569 ntTSL 4 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 SERF1A-204ENST00000504458 569 ntTSL 4 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 RN7SKP248-201ENST00000516278 305 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 IGKV3D-25-201ENST00000519599 235 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 AP003031.2-204ENST00000527219 567 ntTSL 4 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 AC127024.4-201ENST00000585212 308 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 LINC01862-201ENST00000593792 478 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 AC120349.1-201ENST00000599498 282 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 AC091167.5-201ENST00000605689 894 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 AC245014.3-201ENST00000618589 347 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 AL031665.2-201ENST00000620712 209 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 AC018659.2-201ENST00000624690 715 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 LINC02341-201ENST00000637043 824 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 AC119674.1-202ENST00000641333 1860 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 PYROXD1-205ENST00000538582 3639 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 PMS2-203ENST00000382321 1386 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 AL354854.1-201ENST00000455940 1363 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 IGIP-201ENST00000333305 3458 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 HIST1H1A-201ENST00000244573 648 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 DAOA-202ENST00000375936 742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 FRMPD4-AS1-201ENST00000425057 285 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 AC007278.2-201ENST00000436582 1200 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 PPIAP27-201ENST00000453800 265 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 AC068228.1-201ENST00000461723 211 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 AC023194.2-201ENST00000465398 406 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 LINC02374-201ENST00000503637 743 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 AL158068.1-201ENST00000506116 616 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 AC239584.1-201ENST00000510419 732 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 IGKV2-19-201ENST00000518132 283 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 AC110056.1-201ENST00000525759 911 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 RPA2P1-201ENST00000556557 721 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 AC087501.3-201ENST00000576477 513 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 AC005703.3-201ENST00000579159 373 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 AC008507.3-201ENST00000585753 472 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 RMDN2-AS1-203ENST00000601029 613 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 RPL12P48-201ENST00000605620 304 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 AP001153.1-201ENST00000641024 338 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 AC008627.1-201ENST00000517511 1704 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 LINC02153-202ENST00000522604 1644 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 GPR89A-213ENST00000534502 1644 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 ZNF184-202ENST00000377419 2899 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 AC068769.1-201ENST00000474767 2426 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 QRSL1P1-201ENST00000400977 1540 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 MTOR-202ENST00000376838 4017 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 AC123769.1-201ENST00000530992 3192 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.6 ms