Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 AL133264.2-201ENST00000453179 555 ntTSL 4 BASIC10.38□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 ACA64.3-201ENST00000459613 127 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 TAF8-205ENST00000465926 1222 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 RN7SL110P-201ENST00000498222 283 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 AC112484.3-201ENST00000505910 329 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 IGKV2-36-201ENST00000519999 223 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 AC090281.1-201ENST00000523019 276 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 CKLF-CMTM1-201ENST00000527729 585 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 AL110292.1-202ENST00000552303 568 ntTSL 4 BASIC10.38□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 RBMX-207ENST00000562646 2148 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 AC020978.2-201ENST00000563203 428 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 RN7SL353P-201ENST00000579902 252 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 AC008555.4-201ENST00000605481 568 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 LINC02112-203ENST00000606169 419 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 AC126283.1-201ENST00000609440 364 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 AL669942.1-206ENST00000610473 783 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 AL354718.2-201ENST00000618030 371 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 AL512652.1-201ENST00000619006 500 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 AC243654.1-201ENST00000620218 293 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 BDNF-201ENST00000314915 4340 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 SLC12A3-205ENST00000566786 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 ACO1-202ENST00000379923 3601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 AC026358.1-201ENST00000539391 2256 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 RAD50-201ENST00000378823 8306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 LINC01278-204ENST00000609143 2768 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 IST1-201ENST00000329908 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 THSD7A-202ENST00000423059 10663 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 CD163L1-201ENST00000313599 4615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 COL14A1-201ENST00000247781 3450 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 AL360004.1-201ENST00000358748 3258 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 LINC01299-201ENST00000520902 2634 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 TTLL6-202ENST00000393382 3551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 DAB2-217ENST00000545653 4537 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 PRRC2B-202ENST00000357304 11042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 STXBP5-AS1-201ENST00000367477 2927 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 AL445309.1-201ENST00000607565 1989 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 C14orf159-211ENST00000518868 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 SLIT2-212ENST00000622093 6380 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 FDFT1-222ENST00000538689 2289 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 P2RX6-202ENST00000413302 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 LARP4-206ENST00000518444 2853 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 NLRP12-205ENST00000391775 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 UNC45B-202ENST00000394570 5638 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 VCPIP1-201ENST00000310421 9942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 NRXN3-217ENST00000634499 6069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 ACOD1-202ENST00000449753 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 LINC01411-203ENST00000507361 2098 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 AKAP1-206ENST00000571629 3105 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 BCAS3-217ENST00000588462 3559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 NEFM-201ENST00000221166 4020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 PKP2-202ENST00000340811 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 ZMAT3-201ENST00000311417 9406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 DDX19B-201ENST00000288071 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 RPS21-201ENST00000343986 344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 RN7SKP239-201ENST00000364814 295 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 S100A8-201ENST00000368732 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 S100A8-202ENST00000368733 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 RBMX2-202ENST00000370947 798 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 TRBV5-3-201ENST00000390362 343 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 AL355864.1-201ENST00000401937 526 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 SNORA77.1-201ENST00000408156 125 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 AC105052.2-201ENST00000434317 794 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 AC079612.2-201ENST00000446029 348 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 RPL36AP55-201ENST00000454114 305 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 RN7SL717P-201ENST00000478343 297 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 RN7SL291P-201ENST00000487916 289 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 AL117692.1-201ENST00000494283 713 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 AP002784.1-201ENST00000506309 546 ntTSL 4 BASIC10.37□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 AC022034.1-201ENST00000512867 2156 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 AC112722.1-201ENST00000514884 587 ntTSL 4 BASIC10.37□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 KCTD21-AS1-202ENST00000523626 555 ntTSL 4 BASIC10.37□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.37□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 ACTR3C-205ENST00000539352 570 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 SLC7A7-210ENST00000554517 1158 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 TGIF2LX-202ENST00000561129 928 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 ARPP19-213ENST00000569723 550 ntTSL 4 BASIC10.37□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 TMEM97-203ENST00000582113 493 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
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