Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 OR5M2P-202ENST00000641241 4242 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 CNTRL-212ENST00000613863 2418 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 OR2AP1-202ENST00000641114 1548 ntAPPRIS P1 BASIC7.78□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 TRIM49D1-203ENST00000605881 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 SSX7-201ENST00000298181 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 ESRP1-201ENST00000358397 3756 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 ZNF268-213ENST00000542986 3773 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 LINC01268-201ENST00000434296 2755 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 TMEM135-202ENST00000340353 3938 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 NPIPB4-203ENST00000415645 3606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 CPB2-AS1-202ENST00000606243 2185 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 LIMD1-201ENST00000273317 11331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 EML5-201ENST00000380664 5910 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 CD46-203ENST00000354848 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 USP48-203ENST00000374732 3037 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AC129502.1-201ENST00000623261 1654 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 OR11G2-202ENST00000641682 3786 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 TMEM217-202ENST00000356757 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AP002800.1-201ENST00000624982 2225 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 ANLN-201ENST00000265748 4787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AC096571.1-201ENST00000325407 306 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 MTIF3-203ENST00000405591 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AC000089.1-201ENST00000424559 801 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 CDC27P1-201ENST00000445384 715 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 HBBP1-202ENST00000454892 455 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 GLRXP3-201ENST00000470810 321 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 RN7SL70P-201ENST00000478322 302 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AC098818.1-201ENST00000478593 252 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 MTERF4-220ENST00000495694 909 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AC008565.1-201ENST00000509046 885 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AC097515.1-202ENST00000511818 371 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AC138517.1-201ENST00000515724 568 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AC008691.1-202ENST00000521472 811 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AC103952.1-201ENST00000521872 590 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AC007537.1-201ENST00000539347 327 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 LINC02384-207ENST00000542875 551 ntTSL 4 BASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 LINC02402-201ENST00000550337 1212 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AL049830.4-201ENST00000555149 351 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AC027104.1-201ENST00000563702 681 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 LINC01919-203ENST00000581198 598 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AP005120.1-202ENST00000584321 506 ntTSL 4 BASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 ODF4-202ENST00000584943 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AP001269.1-201ENST00000592820 528 ntTSL 4 BASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 LINC02028-206ENST00000593326 810 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 OR2BH1P-201ENST00000608850 864 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 HOXA11-AS1_3.1-201ENST00000613383 98 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AP005212.3-201ENST00000619964 528 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AC069542.2-201ENST00000624816 216 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 TMEM192-201ENST00000306480 10012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 UNC79-206ENST00000621021 7377 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 CDC7-203ENST00000428239 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 DPY19L1P1-201ENST00000417811 2594 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 LOXHD1-201ENST00000300591 3970 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 SCIN-201ENST00000297029 9713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 MUM1L1-201ENST00000337685 4308 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 NAT10-201ENST00000257829 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 NAV2-203ENST00000396085 11000 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 PGM3-212ENST00000513973 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 SLC3A1-206ENST00000409740 1418 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 SPRYD4-201ENST00000338146 10779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 UNC79-202ENST00000393151 7908 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 PSMD5-AS1-213ENST00000640327 3531 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 AC023818.2-201ENST00000623817 2304 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 UBR1-202ENST00000546274 3332 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 PDGFRA-206ENST00000508170 2202 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 NTRK3-212ENST00000558676 4670 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 ZHX3-201ENST00000309060 10030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 SERPINB13-202ENST00000344731 3114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 KAT6B-205ENST00000372725 6944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 NARS2-204ENST00000528850 2137 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 NXT2-203ENST00000372106 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 CAST-204ENST00000341926 2487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 ATP1A4-201ENST00000368081 3839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 SPINK5-203ENST00000398454 2915 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 PFKFB1-203ENST00000545676 1591 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 SNTN-203ENST00000496807 3746 ntTSL 4 BASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 RSPH4A-201ENST00000229554 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 CHURC1-203ENST00000549115 2629 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 WDR89-202ENST00000394942 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 LINC00269-201ENST00000399711 2173 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 FAM122C-201ENST00000370784 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 ENSA-214ENST00000513281 1369 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 C1GALT1-201ENST00000223122 6078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD8P13378 GUCY1B2-203ENST00000493639 2871 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
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