Protein–RNA interactions for Protein: O14908

GIPC1, PDZ domain-containing protein GIPC1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1O14908 PKIB-211ENST00000615438 1936 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
GIPC1O14908 RNF14-204ENST00000394519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
GIPC1O14908 CD160-205ENST00000616463 3388 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
GIPC1O14908 NF1-202ENST00000358273 12425 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
GIPC1O14908 LEO1-201ENST00000299601 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
GIPC1O14908 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
GIPC1O14908 AL450327.1-201ENST00000430931 2632 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
GIPC1O14908 CD86-209ENST00000493101 1572 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
GIPC1O14908 ARHGAP32-201ENST00000310343 10111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
GIPC1O14908 UTP6-201ENST00000261708 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
GIPC1O14908 KDELC2-202ENST00000434945 4374 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
GIPC1O14908 SETDB1-201ENST00000271640 4437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
GIPC1O14908 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
GIPC1O14908 CD163-209ENST00000541972 3590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
GIPC1O14908 CDC40-201ENST00000307731 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
GIPC1O14908 BCL2L14-204ENST00000396367 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
GIPC1O14908 AP000866.1-202ENST00000529392 2792 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
GIPC1O14908 AC007012.2-201ENST00000623206 1676 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
GIPC1O14908 OR10K2-202ENST00000641042 3023 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
GIPC1O14908 AC116366.1-201ENST00000443093 3730 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
GIPC1O14908 LINC01958-201ENST00000637749 1941 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
GIPC1O14908 TSHZ2-201ENST00000329613 3093 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
GIPC1O14908 RAD54B-202ENST00000336148 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
GIPC1O14908 CDY1-202ENST00000361963 2177 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
GIPC1O14908 DNAJC16-202ENST00000375847 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
GIPC1O14908 PBLD-203ENST00000336578 2449 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
GIPC1O14908 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
GIPC1O14908 HYPM-201ENST00000341016 501 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
GIPC1O14908 FCAR-204ENST00000359272 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
GIPC1O14908 SNORA73B-201ENST00000363217 204 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
GIPC1O14908 RGS8-202ENST00000367556 843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
GIPC1O14908 MIR323B-201ENST00000385269 82 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
GIPC1O14908 IGLV3-10-201ENST00000390315 382 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
GIPC1O14908 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
GIPC1O14908 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
GIPC1O14908 GAPDHP51-201ENST00000426454 1000 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
GIPC1O14908 AP000233.1-201ENST00000426609 291 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
GIPC1O14908 LINC01522-201ENST00000428999 429 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
GIPC1O14908 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
GIPC1O14908 GTF2F2P2-201ENST00000445825 721 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
GIPC1O14908 AC006026.3-201ENST00000454029 143 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
GIPC1O14908 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
GIPC1O14908 AC234771.3-201ENST00000454984 622 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
GIPC1O14908 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
GIPC1O14908 AC019084.1-201ENST00000457337 432 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
GIPC1O14908 IQCJ-SCHIP1-AS1-201ENST00000460574 508 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
GIPC1O14908 RN7SL55P-201ENST00000464534 297 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
GIPC1O14908 RPL35AP19-201ENST00000469425 329 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
GIPC1O14908 AC131233.1-201ENST00000479200 955 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
GIPC1O14908 RN7SL332P-201ENST00000482163 254 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
GIPC1O14908 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
GIPC1O14908 PRELID3BP7-201ENST00000503606 469 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
GIPC1O14908 AC105420.1-201ENST00000504389 582 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
GIPC1O14908 AC093903.1-201ENST00000507220 405 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
GIPC1O14908 BTG4P1-201ENST00000510421 183 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
GIPC1O14908 AC097103.2-205ENST00000515247 567 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
GIPC1O14908 HDAC2-AS2-207ENST00000518470 563 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
GIPC1O14908 AC025370.1-201ENST00000523775 583 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
GIPC1O14908 AP005597.2-201ENST00000526238 341 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
GIPC1O14908 AC104241.1-201ENST00000530039 628 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
GIPC1O14908 OR7E87P-201ENST00000532397 929 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
GIPC1O14908 AC089984.3-201ENST00000552838 363 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
GIPC1O14908 TMEM202-202ENST00000567679 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
GIPC1O14908 MIR5708-201ENST00000579723 85 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
GIPC1O14908 AC061975.3-201ENST00000583209 244 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
GIPC1O14908 EIF4A2P1-201ENST00000587313 1063 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
GIPC1O14908 AC009303.2-206ENST00000588042 786 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
GIPC1O14908 SATB1-AS1-222ENST00000600177 751 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
GIPC1O14908 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
GIPC1O14908 AL096855.2-201ENST00000605785 369 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
GIPC1O14908 AC103724.4-201ENST00000605981 292 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
GIPC1O14908 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
GIPC1O14908 AL359757.1-201ENST00000623176 255 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
GIPC1O14908 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
GIPC1O14908 RPL23AP61-201ENST00000623642 466 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
GIPC1O14908 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
GIPC1O14908 BANCR-201ENST00000624238 473 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
GIPC1O14908 METAP1-212ENST00000625963 147 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
GIPC1O14908 AL392088.2-201ENST00000637607 285 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
GIPC1O14908 UEVLD-202ENST00000320750 1799 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
GIPC1O14908 CORO1C-202ENST00000420959 3921 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
GIPC1O14908 USP48-203ENST00000374732 3037 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
GIPC1O14908 AC005840.3-201ENST00000541888 1803 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
GIPC1O14908 USPL1-203ENST00000614860 4074 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
GIPC1O14908 NAP1L1-227ENST00000618691 13505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
GIPC1O14908 UGT2B4-201ENST00000305107 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
GIPC1O14908 RNASE13-201ENST00000382951 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
GIPC1O14908 LNPEP-202ENST00000395770 3888 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
GIPC1O14908 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
GIPC1O14908 ARRDC3-201ENST00000265138 4188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
GIPC1O14908 STAG1-201ENST00000236698 5951 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
GIPC1O14908 AC068860.1-201ENST00000623701 3736 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
GIPC1O14908 SLA-201ENST00000338087 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
GIPC1O14908 GPR18-201ENST00000340807 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
GIPC1O14908 RBM41-201ENST00000372479 1662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
GIPC1O14908 AL035665.1-201ENST00000428495 1669 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
GIPC1O14908 CSDE1-201ENST00000261443 3228 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
GIPC1O14908 PPP1R1C-202ENST00000409137 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
GIPC1O14908 AL391262.1-201ENST00000556558 1992 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
GIPC1O14908 MED21-201ENST00000282892 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96 ms