Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 CU634019.4-201ENST00000623347 897 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AC018659.2-201ENST00000624690 715 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AJ009632.2-209ENST00000634853 933 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AL596275.2-207ENST00000641188 675 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 ANKRD12-201ENST00000262126 11288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AC019072.1-201ENST00000604535 1551 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 VTCN1-207ENST00000539893 2719 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 SCML2-202ENST00000398048 1334 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AC097512.1-201ENST00000511453 1309 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 SULT1C2-205ENST00000437390 1359 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 ERAP2-202ENST00000437043 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 CACNA1E-209ENST00000621551 14886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 CASP5-201ENST00000260315 1414 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 MGP-203ENST00000539261 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 PCDH18-203ENST00000507846 4625 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02097-201ENST00000419257 2063 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 RBMS2-202ENST00000542360 1484 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 LYSMD3-203ENST00000500869 3863 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AC090181.3-201ENST00000624777 1514 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AC005225.5-201ENST00000623547 2225 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 RGS22-215ENST00000523437 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 NRCAM-201ENST00000351718 6228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AP005139.1-201ENST00000580702 1647 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 MTHFD2P5-201ENST00000320415 844 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 PPIAP24-201ENST00000328558 471 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 SCGB1D4-201ENST00000358585 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 MRRF-203ENST00000373723 1176 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 U3.52-201ENST00000384034 216 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 PTGES3P2-201ENST00000407942 482 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 BCL11A-205ENST00000409351 756 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 METTL5-205ENST00000409837 936 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 ALDH7A1P4-201ENST00000412255 178 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AL035604.1-201ENST00000416481 531 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AC009506.2-201ENST00000420635 840 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 OR13C7-201ENST00000424348 959 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AKR1B10P1-201ENST00000425765 942 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AL158832.1-201ENST00000429661 406 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AC099796.1-201ENST00000433377 683 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 COL11A2P1-205ENST00000441798 676 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AC011742.2-201ENST00000443818 352 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 MTND5P8-201ENST00000449817 1083 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AC108729.2-201ENST00000476543 840 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AC104078.2-201ENST00000504344 541 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 RPS3A-204ENST00000506126 862 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AC016642.1-202ENST00000509476 641 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 WDFY3-AS1-201ENST00000510449 493 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AC106800.3-201ENST00000511389 308 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AC022784.1-201ENST00000512942 699 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 OR52H2P-201ENST00000514607 902 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC6.92□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 OR9L1P-201ENST00000529493 933 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 OR8K4P-201ENST00000534608 872 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AP000593.3-201ENST00000546065 578 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AL133304.2-201ENST00000546376 886 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AC018767.2-201ENST00000562361 600 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 MT1CP-201ENST00000567054 174 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AC015911.5-201ENST00000587076 451 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01198-204ENST00000594153 552 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AP000654.1-201ENST00000602510 1192 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AC012368.3-201ENST00000604190 219 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AC114477.1-201ENST00000605097 605 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD96A-201ENST00000606577 79 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AC005828.7-201ENST00000607331 556 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AC092902.3-201ENST00000610060 373 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 EDRF1-AS1-210ENST00000613304 569 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AC010333.3-201ENST00000615100 402 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01685-203ENST00000634464 1201 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 MIR548A1HG-202ENST00000637804 784 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 CSTF3-201ENST00000323959 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 NCOR1-204ENST00000395851 7950 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 B3GALT5-203ENST00000380620 13170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 NAMPTP1-201ENST00000440465 2514 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AC003973.2-201ENST00000596778 1394 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 CEP44-206ENST00000503780 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AC023245.2-201ENST00000530760 2978 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01931-201ENST00000295052 1832 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00517-202ENST00000554257 3460 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 LRRN3-201ENST00000308478 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 FGF1-216ENST00000621536 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 WDR95P-201ENST00000425638 1542 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 DTNA-226ENST00000596745 1508 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 SPRY3-201ENST00000302805 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 HOXD8-202ENST00000429017 1608 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 RRN3P1-201ENST00000514813 3645 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 AC062029.1-202ENST00000606164 3651 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 NCAPG2-202ENST00000409339 5253 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 OR1Q1-201ENST00000297913 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.91□□□□□ -1.3
SH3BP1Q9Y3L3 CCR8-201ENST00000326306 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131 ms