Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 TMEM257-201ENST00000408967 2441 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 CHN1-201ENST00000295497 2047 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 AC139426.3-201ENST00000605648 2059 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 ZNF101P1-201ENST00000435701 1720 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 GRIA2-204ENST00000393815 5260 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 VNN3-207ENST00000425515 1761 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 CXADRP1-201ENST00000398098 1095 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 RPL23AP17-201ENST00000401064 499 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 VN1R12P-201ENST00000403778 876 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 LINC00396-201ENST00000411690 439 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 AC244035.2-201ENST00000425896 630 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 AC008073.2-201ENST00000428344 792 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 AL365220.1-201ENST00000432923 399 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 AL031186.1-201ENST00000433125 385 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 GAPDHP75-201ENST00000433910 943 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 CST12P-201ENST00000457644 362 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 AC108941.2-201ENST00000506796 716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 ALG9-IT1-201ENST00000531305 684 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 AC002056.2-201ENST00000532913 284 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 AL355075.2-201ENST00000555435 478 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 RPA2P1-201ENST00000556557 721 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 LINC02193-202ENST00000566864 719 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 MIR4271-201ENST00000582451 67 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 AC100863.1-201ENST00000584843 560 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 AL117336.3-201ENST00000603160 1107 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 AC108673.3-201ENST00000609183 335 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 AC104836.2-201ENST00000609675 1293 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 CXADRP3-202ENST00000617265 1100 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 AC069234.4-201ENST00000621276 412 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 PRKCH-228ENST00000640011 285 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 OR2AG1-202ENST00000641258 6993 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 ZEB2-244ENST00000638007 9140 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 DCC-203ENST00000442544 10206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 MYO5A-209ENST00000553916 5989 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 LINC01602-201ENST00000522992 2109 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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CLDN19Q8N6F1 AL355377.1-201ENST00000621125 1653 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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CLDN19Q8N6F1 AP002001.1-201ENST00000526101 1759 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 CDH7-201ENST00000323011 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 RNASE9-209ENST00000557068 2703 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 OR8U1-201ENST00000302270 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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CLDN19Q8N6F1 LINC01091-201ENST00000508111 645 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 AC025366.1-201ENST00000523264 202 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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CLDN19Q8N6F1 GPRC5D-AS1-203ENST00000536029 466 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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CLDN19Q8N6F1 AL162464.1-201ENST00000557642 554 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 AC018558.5-201ENST00000565840 952 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 AC090826.1-203ENST00000569235 490 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 AC134669.1-201ENST00000581275 672 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 AP003789.1-201ENST00000617737 605 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 AC245014.3-201ENST00000618589 347 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 SSX4B-202ENST00000619890 1092 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 SSX4-202ENST00000620320 1092 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 TRMT13-202ENST00000370141 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CLDN19Q8N6F1 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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