Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI63

KRTAP20-1, Keratin-associated protein 20-1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP20-1Q3LI63 ANKRD26P1-204ENST00000571006 4741 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP20-1Q3LI63 MAVS-202ENST00000428216 11714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP20-1Q3LI63 AC115220.1-201ENST00000330020 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP20-1Q3LI63 Z93929.1-201ENST00000418200 1475 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP20-1Q3LI63 THBS4-204ENST00000511733 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP20-1Q3LI63 CCDC85C-201ENST00000380243 16393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP20-1Q3LI63 KIT-201ENST00000288135 5186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP20-1Q3LI63 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP20-1Q3LI63 CD163-202ENST00000396620 3800 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP20-1Q3LI63 SALL1P1-201ENST00000438101 3837 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP20-1Q3LI63 PPP1R2P3-201ENST00000522232 1991 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP20-1Q3LI63 ZFY-202ENST00000383052 5113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP20-1Q3LI63 LINC01720-201ENST00000413356 2216 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP20-1Q3LI63 LINC02260-201ENST00000508484 2216 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP20-1Q3LI63 WDPCP-206ENST00000409562 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP20-1Q3LI63 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF468-201ENST00000243639 4027 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP20-1Q3LI63 WDR44-203ENST00000371825 4029 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP20-1Q3LI63 EIF5A2-201ENST00000295822 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP20-1Q3LI63 USP16-203ENST00000399975 2960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP20-1Q3LI63 DLEU1-212ENST00000469754 2955 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP20-1Q3LI63 BCL2L14-211ENST00000586576 1927 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP20-1Q3LI63 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP20-1Q3LI63 LINC00536-201ENST00000505156 2692 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP20-1Q3LI63 LRRC4C-204ENST00000530763 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP20-1Q3LI63 TRIM64-201ENST00000533122 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF14-201ENST00000344099 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP20-1Q3LI63 BCO2-201ENST00000357685 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP20-1Q3LI63 ERG-206ENST00000398911 4914 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP20-1Q3LI63 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP20-1Q3LI63 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP20-1Q3LI63 MAMDC2-201ENST00000377182 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP20-1Q3LI63 TRMT10A-202ENST00000394876 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP20-1Q3LI63 AL355488.1-201ENST00000449169 2611 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP20-1Q3LI63 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF417-201ENST00000312026 3597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP20-1Q3LI63 PLCE1-201ENST00000371375 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP20-1Q3LI63 AC022075.1-201ENST00000500682 2830 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP20-1Q3LI63 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP20-1Q3LI63 GPI-202ENST00000415930 4000 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP20-1Q3LI63 USO1-204ENST00000514213 4034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP20-1Q3LI63 CECR2-206ENST00000612582 9645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP20-1Q3LI63 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP20-1Q3LI63 SYNE1-237ENST00000539504 3768 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP20-1Q3LI63 AC034111.1-201ENST00000562143 3770 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP20-1Q3LI63 TM2D2-202ENST00000456397 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP20-1Q3LI63 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP20-1Q3LI63 LINC00210-201ENST00000431637 1584 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF227-201ENST00000313040 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF260-202ENST00000523638 5666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF396-201ENST00000306346 2788 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP20-1Q3LI63 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP20-1Q3LI63 AL353807.3-201ENST00000500626 2505 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP20-1Q3LI63 PDE7A-202ENST00000396642 2986 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP20-1Q3LI63 CACNB4-269ENST00000638005 4615 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP20-1Q3LI63 SRPK2-202ENST00000393651 3650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP20-1Q3LI63 DIS3-205ENST00000545453 3651 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP20-1Q3LI63 PRLR-216ENST00000542609 1764 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP20-1Q3LI63 OR9Q1-201ENST00000335397 2488 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP20-1Q3LI63 BMX-201ENST00000342014 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP20-1Q3LI63 PCDH15-231ENST00000617271 6425 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP20-1Q3LI63 FRMD6-202ENST00000356218 4768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP20-1Q3LI63 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP20-1Q3LI63 PEG3-201ENST00000326441 8723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP20-1Q3LI63 UNC13B-210ENST00000636694 8012 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF28-201ENST00000339844 650 ntTSL 4 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP20-1Q3LI63 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP20-1Q3LI63 RN7SKP149-201ENST00000363008 344 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP20-1Q3LI63 TRGV8-201ENST00000390343 468 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP20-1Q3LI63 GAPDHP42-201ENST00000406848 981 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP20-1Q3LI63 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP20-1Q3LI63 RN7SKP207-201ENST00000411204 303 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP20-1Q3LI63 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP20-1Q3LI63 AC069213.2-201ENST00000420238 366 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP20-1Q3LI63 RCC2P2-201ENST00000422174 918 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP20-1Q3LI63 AL035404.2-201ENST00000424418 304 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP20-1Q3LI63 AL031767.1-201ENST00000426374 386 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP20-1Q3LI63 AC005083.1-202ENST00000430859 740 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP20-1Q3LI63 OR6C71P-201ENST00000432580 913 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP20-1Q3LI63 Z83313.1-201ENST00000433780 718 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP20-1Q3LI63 TRIM60P16-201ENST00000444048 694 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP20-1Q3LI63 AP000302.1-201ENST00000450928 666 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP20-1Q3LI63 GEMIN2P1-201ENST00000454246 752 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP20-1Q3LI63 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP20-1Q3LI63 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP20-1Q3LI63 ST20-201ENST00000478497 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP20-1Q3LI63 RPL7P16-201ENST00000479738 738 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP20-1Q3LI63 AP005202.1-201ENST00000489915 867 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP20-1Q3LI63 PANCR-201ENST00000503456 493 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP20-1Q3LI63 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP20-1Q3LI63 RPEP1-201ENST00000504507 658 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF721-203ENST00000506646 935 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP20-1Q3LI63 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP20-1Q3LI63 AC022784.1-201ENST00000512942 699 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP20-1Q3LI63 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP20-1Q3LI63 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KRTAP20-1Q3LI63 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.6 ms