Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 BLOC1S2-206ENST00000618916 2470 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 CFAP54-202ENST00000524981 9766 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 RAD54B-201ENST00000297592 1879 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 CTXN3-201ENST00000379445 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 HIST1H2BA-201ENST00000274764 516 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 RN7SKP62-201ENST00000384539 329 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 AC009965.1-201ENST00000411436 570 ntTSL 4 BASIC7.84□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 AL713923.1-201ENST00000414071 378 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 RBM22P7-201ENST00000421321 280 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 AC006065.1-201ENST00000422539 802 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 AC093084.1-201ENST00000424233 687 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 AL008723.2-201ENST00000426354 562 ntTSL 4 BASIC7.84□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 AL157400.1-201ENST00000428166 368 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 MIR181A1HG-202ENST00000432296 930 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 AL022157.1-201ENST00000439622 665 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 RPL36AP55-201ENST00000454114 305 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 AL391863.1-202ENST00000457427 612 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 RN7SL259P-201ENST00000478499 253 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 AF305872.1-201ENST00000485217 471 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 TECRP2-201ENST00000503270 928 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 LINC02059-201ENST00000503843 452 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 SMR3B-202ENST00000504825 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 PABPC1P1-201ENST00000506347 591 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 RPL7L1P7-201ENST00000509986 724 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 AC025370.1-201ENST00000523775 583 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 AC090193.1-202ENST00000524355 566 ntTSL 4 BASIC7.84□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 AP001007.2-201ENST00000525429 593 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 KCTD9P4-201ENST00000526766 1166 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 SSU72P6-201ENST00000532644 488 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 AC023796.1-201ENST00000536131 670 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 LINC02451-201ENST00000546982 565 ntTSL 4 BASIC7.84□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 LINC00929-203ENST00000556213 713 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 AC023206.1-201ENST00000605824 298 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 AL021368.3-201ENST00000607119 578 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 AC241377.2-201ENST00000612313 553 ntTSL 4 BASIC7.84□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 FRG1HP-204ENST00000617940 757 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 AC008626.2-201ENST00000624425 248 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 AC026108.1-201ENST00000635444 547 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 EIF3L-203ENST00000412331 3220 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 CFAP57-204ENST00000528956 3037 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
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ECM1Q16610 FCHSD2-203ENST00000409314 4509 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 ERVFRD-1-201ENST00000472091 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
ECM1Q16610 KIF4A-201ENST00000374403 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
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ECM1Q16610 SYNPO2-203ENST00000434046 3588 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
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ECM1Q16610 UTY-210ENST00000538878 6574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
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ECM1Q16610 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 TRAF5-202ENST00000336184 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
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ECM1Q16610 GCNT1-202ENST00000442371 5972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 TTC21A-203ENST00000431162 4209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 GNE-205ENST00000539815 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 MED13L-201ENST00000281928 14234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
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ECM1Q16610 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 XAGE5-202ENST00000375501 415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
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ECM1Q16610 AL731661.2-201ENST00000448824 806 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
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ECM1Q16610 AC022784.1-201ENST00000512942 699 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 AC022441.2-201ENST00000514113 382 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
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ECM1Q16610 COX6C-205ENST00000520468 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 AC025035.1-201ENST00000551571 894 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 AL135978.1-201ENST00000553618 1266 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 AC021979.2-201ENST00000553644 209 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 AL133485.1-201ENST00000555966 392 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC7.83□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
ECM1Q16610 AC027104.1-201ENST00000563702 681 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
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