Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 DIS3-201ENST00000377767 10604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 ADGRL3-206ENST00000507164 4982 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 RN7SKP103-201ENST00000363848 320 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 LIX1L-AS1-202ENST00000412239 570 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 CASKP1-201ENST00000412870 582 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 LINC02246-202ENST00000418954 717 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 AL513128.1-201ENST00000422675 469 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 LINC00502-201ENST00000423621 445 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 AL139415.1-201ENST00000424862 352 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 CA1-201ENST00000431316 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC7.98□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 FCF1P7-201ENST00000451185 558 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 AC106864.2-201ENST00000505632 740 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 MGAT4D-203ENST00000511113 1125 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 AP002754.2-201ENST00000542121 462 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 AC027229.1-201ENST00000583887 253 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 OR51F2-202ENST00000641672 1136 ntAPPRIS P2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 AC006600.2-201ENST00000624834 2506 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 DLG2-230ENST00000532653 2891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 AC025470.1-201ENST00000510053 2032 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 RSAD2-201ENST00000382040 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 LINC01616-201ENST00000561816 2280 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 VPS8-201ENST00000287546 5047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 AC019080.1-201ENST00000397057 5202 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 Z98257.1-202ENST00000431027 2493 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 KMT2A-213ENST00000534358 16602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 CLEC3A-201ENST00000299642 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 AC138915.4-201ENST00000565549 4147 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 OR2T35-202ENST00000641268 2957 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 MAGEB16-204ENST00000399989 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 ITPR1-204ENST00000443694 9513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 HNRNPR-210ENST00000478691 7646 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 GON4L-201ENST00000271883 7138 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 CCDC169-202ENST00000239860 716 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 RPL35AP24-201ENST00000413846 330 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 FAM204CP-201ENST00000424489 642 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 BTBD7P2-201ENST00000441962 620 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 AC005297.1-201ENST00000444765 862 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 OR7E116P-201ENST00000448529 957 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 LINC02040-201ENST00000481004 556 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
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VPS72Q15906 CCDC169-211ENST00000503173 837 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 LINC02117-201ENST00000513673 540 ntTSL 4 BASIC7.97□□□□□ -1.13
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VPS72Q15906 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
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VPS72Q15906 AP005209.1-201ENST00000582531 928 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 AC012557.1-201ENST00000607115 611 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC7.97□□□□□ -1.13
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VPS72Q15906 NRCAM-203ENST00000379024 5782 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
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VPS72Q15906 SRSF3-202ENST00000373715 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 ZNF610-208ENST00000613461 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 SPATA31B1P-201ENST00000434692 4016 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
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VPS72Q15906 MEIOB-205ENST00000470044 1857 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 CLTC-201ENST00000269122 7760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 AC010099.4-201ENST00000424515 1453 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 AC099811.1-201ENST00000597755 1496 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.13
VPS72Q15906 AL050335.1-201ENST00000396909 869 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 GPC5-AS2-201ENST00000417589 401 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 AC117434.1-201ENST00000419971 836 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 AC022387.1-201ENST00000444770 794 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 LINC01911-201ENST00000450667 806 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 RPL7AP6-201ENST00000477943 801 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 NPM1P28-201ENST00000492269 840 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 OR7E157P-201ENST00000494376 911 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 SSX8-201ENST00000506270 579 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 AC097491.1-201ENST00000507857 672 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 RN7SKP5-201ENST00000517045 272 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 POLR2K-203ENST00000522439 543 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 OR56A7P-201ENST00000524865 941 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
VPS72Q15906 GTF2IP11-201ENST00000526931 420 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
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