Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 ANGPTL5-201ENST00000334289 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 DCC-215ENST00000581580 3517 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 NIN-204ENST00000382043 4216 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 NUP153-201ENST00000262077 5487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 GRIK2-206ENST00000413795 4876 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 AC063923.1-201ENST00000478982 1619 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 BRD8-204ENST00000411594 2967 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 TCF12-207ENST00000557843 4076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 HSD17B13-201ENST00000302219 2269 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 CXCR6-204ENST00000458629 2805 ntAPPRIS P1 BASIC7.81□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 PDGFC-203ENST00000502773 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 TMEM170B-201ENST00000379426 8362 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.81□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 LINC01360-203ENST00000440762 3871 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 AL356317.1-201ENST00000396110 1436 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 VEPH1-205ENST00000468233 1401 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 AL592161.1-201ENST00000456389 861 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 AC112693.1-201ENST00000555297 682 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 AC087763.1-201ENST00000603391 286 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 AC008115.3-201ENST00000614874 549 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 HDAC9-202ENST00000405010 4239 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 DTNA-226ENST00000596745 1508 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 OR5AQ1P-202ENST00000641257 1534 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 OR5AQ1P-203ENST00000641818 1529 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 GREM1-203ENST00000622074 14606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 NFE2L2-204ENST00000423513 1382 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 AC068490.1-202ENST00000637384 3185 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 OGT-202ENST00000373719 5461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 ZNF181-204ENST00000492450 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 LINC01677-204ENST00000635342 1329 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 AC104837.1-201ENST00000444644 1587 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 CFHR5-201ENST00000256785 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 ARFGEF3-201ENST00000251691 14877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 INTS12-202ENST00000394735 1927 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 ZNF106-201ENST00000263805 10460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 MIRLET7DHG-201ENST00000416309 1294 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 AP000402.1-201ENST00000446404 540 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 VN1R48P-201ENST00000448149 1036 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 GLRXP3-201ENST00000470810 321 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 LINC02508-201ENST00000504165 426 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 NSMCE2-206ENST00000519010 848 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 AP000722.1-201ENST00000531176 775 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 RERGL-203ENST00000538724 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 AC012050.1-201ENST00000558185 472 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 AC091151.1-201ENST00000587369 726 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 AC013731.1-201ENST00000604340 883 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 AC009704.2-201ENST00000618739 483 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 SYNPO2-203ENST00000434046 3588 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 AC092807.3-203ENST00000467530 2745 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 ZNF519-207ENST00000590202 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 TMEM192-201ENST00000306480 10012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 HMG20A-202ENST00000381714 4112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 AC011379.1-201ENST00000508713 3025 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 AC127024.8-201ENST00000623719 2094 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 ERAP2-202ENST00000437043 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 HBS1L-212ENST00000527578 2618 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 C2CD5-212ENST00000542676 3438 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 CTAGE11P-201ENST00000451540 2353 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 SPTA1-201ENST00000368147 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 SEMA3A-204ENST00000436949 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 PDLIM5-219ENST00000514743 3356 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 KAT6B-203ENST00000372714 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 CYP2C8-212ENST00000623108 1962 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 LINC01108-201ENST00000427276 3152 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 AL589826.1-201ENST00000340697 249 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 CEACAMP7-201ENST00000444105 496 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
R3HDM1Q15032 AP003774.4-201ENST00000447028 672 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94 ms