Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AC079922.1-201ENST00000443291 359 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 AC144530.1-201ENST00000452862 555 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 RN7SL352P-201ENST00000466002 277 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 LINC01091-201ENST00000508111 645 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 AC090568.1-201ENST00000509499 856 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 CETN3-206ENST00000522864 738 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 CRYAB-205ENST00000526180 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 AC009145.2-201ENST00000562685 377 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 AC040173.1-201ENST00000572479 580 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 AC008109.1-201ENST00000583163 826 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 AC011478.1-201ENST00000593140 554 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 AC108865.2-201ENST00000606881 432 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 AC108673.3-201ENST00000609183 335 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 SNAP23-222ENST00000626061 237 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 SNAP23-223ENST00000627440 210 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 ZNF208-201ENST00000397126 3992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 RAPGEF4-204ENST00000409036 3975 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 CASP10-202ENST00000286186 5928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 AC110373.1-201ENST00000505994 3505 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 DDAH1-204ENST00000535924 3909 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 AFF2-203ENST00000370457 3952 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 NBPF11-204ENST00000614785 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 AC006511.3-201ENST00000624929 1783 ntBASIC6.21□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 TYW3-201ENST00000370867 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 MOCS2-201ENST00000361377 3568 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 NBPF19-205ENST00000612881 3715 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
CDH18Q13634 AC099654.3-201ENST00000447087 1546 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 AL355377.1-201ENST00000621125 1653 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 FLJ12825-201ENST00000515617 3942 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 AC090616.2-201ENST00000358484 431 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 AC023490.2-201ENST00000359859 470 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
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CDH18Q13634 AL138733.1-201ENST00000415477 853 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 AC245884.2-201ENST00000426257 404 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 AL359839.1-201ENST00000451975 1160 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 AL122019.1-202ENST00000458070 546 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 AC018450.1-202ENST00000465880 529 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 SETP21-201ENST00000514799 892 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 ZNF346-IT1-201ENST00000515264 745 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 EIF4EP5-201ENST00000528228 640 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 AC005244.1-201ENST00000582566 339 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 CDC37L1-AS1-202ENST00000609131 235 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 IPO5-229ENST00000631030 192 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 PDE4B-203ENST00000371045 3982 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 KANTR-203ENST00000604062 4251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 OR6N2-202ENST00000641131 3455 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
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CDH18Q13634 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 MEPE-209ENST00000560249 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 PTPRZ1-202ENST00000449182 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 SGMS2-203ENST00000394686 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 MAPK9-213ENST00000539014 1668 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 PLRG1-202ENST00000499023 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 ZFX-202ENST00000338565 2906 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 BLOC1S2-205ENST00000614731 2634 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 OR51E2-203ENST00000641638 2626 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 PSG5-210ENST00000599812 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 GCSAML-210ENST00000536561 4063 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 POLE2-206ENST00000554396 1581 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 OR2T5-201ENST00000641363 2525 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 NOVA1-213ENST00000574031 1431 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 RNFT1P3-201ENST00000340898 1052 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 RN7SKP15-201ENST00000364742 309 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 OR2L2-201ENST00000366479 1134 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 TPT1-204ENST00000379060 764 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 AC022173.1-201ENST00000418554 577 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 AC068631.1-204ENST00000428501 534 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 AL158850.1-201ENST00000441249 914 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 ITGA9-AS1-207ENST00000445429 532 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CDH18Q13634 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
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