Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 LINC00944-204ENST00000544499 366 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 TMEM106C-215ENST00000550552 776 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 LINC01476-202ENST00000584262 635 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 AC073046.2-201ENST00000604756 527 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 SNORA74.4-201ENST00000607595 199 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 AL008582.1-201ENST00000609612 442 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 Metazoa_SRP.77-201ENST00000616915 252 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 AC211486.4-201ENST00000621495 113 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 OR7E91P-202ENST00000642062 1198 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 LTA4H-209ENST00000552789 2025 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 MTHFD2L-201ENST00000325278 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 AC126755.2-201ENST00000545114 1522 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
CUL3Q13618 AC217777.1-201ENST00000570034 1471 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
CUL3Q13618 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL3Q13618 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL3Q13618 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL3Q13618 PLEKHA1-205ENST00000433307 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL3Q13618 NLRC4-202ENST00000360906 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL3Q13618 OR4F17-202ENST00000585993 2669 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL3Q13618 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL3Q13618 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL3Q13618 AP001541.1-201ENST00000623322 1904 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL3Q13618 AL442071.1-201ENST00000289890 558 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL3Q13618 RNA5SP85-201ENST00000365378 119 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL3Q13618 DNAJA1P3-201ENST00000399417 1194 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL3Q13618 OR2A25-201ENST00000408898 1014 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL3Q13618 OR6R1P-201ENST00000431838 940 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL3Q13618 AC128677.1-201ENST00000436016 442 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL3Q13618 VPS25P1-201ENST00000455691 508 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL3Q13618 AC112187.1-201ENST00000455837 479 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL3Q13618 RN7SL393P-201ENST00000463588 296 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL3Q13618 RN7SL643P-201ENST00000471845 291 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL3Q13618 AC010343.2-201ENST00000510162 224 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL3Q13618 AC105389.1-201ENST00000510602 561 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL3Q13618 AL035458.2-201ENST00000512005 478 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL3Q13618 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL3Q13618 TPT1-AS1-206ENST00000519454 709 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL3Q13618 IGHV4-55-201ENST00000520889 368 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL3Q13618 AC008676.3-201ENST00000521237 435 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL3Q13618 AC107909.1-201ENST00000523226 595 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL3Q13618 AC016405.1-202ENST00000524348 758 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL3Q13618 AC080011.1-201ENST00000552378 989 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL3Q13618 AC079793.1-201ENST00000553076 713 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL3Q13618 AL161757.3-201ENST00000555316 807 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL3Q13618 AC084757.2-201ENST00000559165 540 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL3Q13618 AC138907.7-201ENST00000568972 358 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL3Q13618 MIR4732-201ENST00000581873 76 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL3Q13618 AC026898.1-201ENST00000586404 571 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL3Q13618 AC006305.2-201ENST00000589617 552 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL3Q13618 AC006116.9-203ENST00000591036 566 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL3Q13618 AC004160.1-210ENST00000599875 689 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL3Q13618 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL3Q13618 AL390877.1-201ENST00000605704 214 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL3Q13618 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL3Q13618 ARF4-AS1-203ENST00000607782 552 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL3Q13618 NF1P10-201ENST00000613227 742 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL3Q13618 MIR6774-201ENST00000614651 70 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL3Q13618 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL3Q13618 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL3Q13618 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL3Q13618 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL3Q13618 IFI16-202ENST00000340979 2732 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL3Q13618 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL3Q13618 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL3Q13618 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL3Q13618 LINC01822-201ENST00000435682 2098 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL3Q13618 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL3Q13618 CXCL8-201ENST00000307407 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL3Q13618 VEPH1-205ENST00000468233 1401 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CUL3Q13618 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL3Q13618 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL3Q13618 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL3Q13618 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL3Q13618 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL3Q13618 RRN3P1-201ENST00000514813 3645 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL3Q13618 ZNF675-201ENST00000359788 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL3Q13618 TEX50-201ENST00000417563 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL3Q13618 RPL21P50-201ENST00000417698 477 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL3Q13618 AC104463.2-201ENST00000428573 314 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL3Q13618 GAPDHP19-201ENST00000431768 1005 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL3Q13618 SUMO2P8-201ENST00000434672 286 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL3Q13618 CATSPER2P1-205ENST00000446479 419 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL3Q13618 PPIAP32-201ENST00000449940 472 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL3Q13618 AL450345.1-201ENST00000456118 311 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL3Q13618 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL3Q13618 OR9A1P-202ENST00000484361 945 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL3Q13618 MBNL1-217ENST00000485509 1023 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL3Q13618 MBNL1-219ENST00000492948 1054 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL3Q13618 AC093816.1-201ENST00000515076 913 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL3Q13618 AC022784.5-201ENST00000522241 437 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL3Q13618 AP000851.1-202ENST00000542119 743 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL3Q13618 CTNNA3-205ENST00000545309 555 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL3Q13618 AC079600.3-201ENST00000547898 447 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL3Q13618 AC009729.1-201ENST00000548873 1133 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL3Q13618 AC037479.1-201ENST00000558361 625 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL3Q13618 AC026462.3-201ENST00000565153 557 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CUL3Q13618 AC024267.2-201ENST00000582737 417 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms