Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 OR6R1P-201ENST00000431838 940 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 AC092824.1-201ENST00000483524 576 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 AC096746.1-201ENST00000501965 1042 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 AC114324.2-202ENST00000503812 134 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 LINC01017-201ENST00000508823 768 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 CENPK-210ENST00000510354 1124 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 AP003100.1-201ENST00000524772 832 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 AC084337.1-201ENST00000524809 686 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 AP000851.1-202ENST00000542119 743 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC9.45□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 AC078778.2-201ENST00000553061 567 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 YWHAZP1-201ENST00000556286 722 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 AC012368.3-201ENST00000604190 219 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 AC019257.2-201ENST00000605539 497 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 AC025171.4-201ENST00000607250 1047 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 AP003497.2-201ENST00000624220 967 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 BNIP3L-202ENST00000518611 1352 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 CUZD1-205ENST00000368904 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 ACPP-202ENST00000351273 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 LINC01297-204ENST00000621052 4222 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 LINC02388-201ENST00000550678 1975 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 GPR1-209ENST00000612892 2565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.44□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 METTL5-202ENST00000308099 629 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 IGHV6-1-201ENST00000390593 415 ntAPPRIS P1 BASIC9.44□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 TXNL1P1-201ENST00000429528 554 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 AC079763.1-201ENST00000441295 738 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 SETD6P1-201ENST00000444575 317 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 AL023581.2-201ENST00000454588 552 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 AC245088.1-201ENST00000486508 384 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 AC018645.1-201ENST00000505003 109 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 ANAPC10-213ENST00000512680 505 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 AC138517.1-201ENST00000515724 568 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 LINC00589-202ENST00000518623 938 ntTSL 4 BASIC9.44□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 NEDD8-203ENST00000524927 653 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 CTNNA3-205ENST00000545309 555 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 MTND2P17-201ENST00000550281 688 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 TMEM106C-215ENST00000550552 776 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 AC234775.3-201ENST00000564612 656 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 Z98949.1-204ENST00000595102 731 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 AC091769.2-201ENST00000605385 479 ntTSL 4 BASIC9.44□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 AC015819.1-201ENST00000613588 663 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 BRCC3-209ENST00000620502 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 PLCB1-202ENST00000378637 3864 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 LINC01440-201ENST00000416190 1340 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 SORT1-209ENST00000538502 6993 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 LINC01741-201ENST00000427173 1666 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 CYP3A5-201ENST00000222982 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 LINC01751-201ENST00000569178 1770 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 N4BP2L1-209ENST00000530622 1897 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 NAV1-201ENST00000367295 11645 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 FASTKD1-204ENST00000453153 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 AL157831.2-201ENST00000564681 3095 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 PLCB4-202ENST00000378473 5619 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 IBTK-210ENST00000610980 5195 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 HUWE1-203ENST00000342160 14796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 KRT39-201ENST00000355612 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 SAGE3P-201ENST00000619800 1635 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 LGSN-204ENST00000622415 1612 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 PTPRT-209ENST00000612229 11285 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 PTK2-201ENST00000340930 4414 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 AC217777.1-201ENST00000570034 1471 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 OR4K17-201ENST00000315543 1032 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 SNORA64.3-201ENST00000365647 134 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 ST3GAL3-212ENST00000372362 468 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 NUDT5-203ENST00000378940 1126 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 RN7SKP281-201ENST00000410472 352 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 MRPS21P5-201ENST00000417885 231 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 Z97206.2-201ENST00000423489 589 ntTSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 AL353148.1-202ENST00000424701 551 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 AL121902.1-201ENST00000426963 459 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 AC083862.1-201ENST00000427378 1242 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 AL590623.1-201ENST00000427864 105 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 AC117944.1-201ENST00000430748 641 ntTSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 UBE2V1P1-201ENST00000430836 445 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 AC005008.2-201ENST00000431501 715 ntTSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 MRPL50P1-201ENST00000431951 384 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 AC016582.1-203ENST00000433142 502 ntTSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 AL356121.1-201ENST00000442911 156 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 AL121584.1-201ENST00000453972 519 ntTSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 AC115223.1-201ENST00000466377 870 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 195.7 ms