Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 AC097515.1-201ENST00000512370 435 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 EIF3KP1-201ENST00000513279 656 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 AC079015.1-201ENST00000521793 596 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 KCTD9P6-201ENST00000522306 950 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 AP001804.1-201ENST00000526868 919 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 NAV2-AS3-201ENST00000534036 598 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 OR4A6P-201ENST00000534364 970 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 AC068790.1-201ENST00000536166 355 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 OR5AP2-201ENST00000544374 1006 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 MALAT1-203ENST00000544868 480 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 LINC02451-201ENST00000546982 565 ntTSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 LINC02290-201ENST00000554187 608 ntTSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 AC013489.1-201ENST00000561140 598 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 UBE2CP4-201ENST00000561405 535 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 MIR4470-201ENST00000583453 72 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 LINC00907-202ENST00000585639 915 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 MAGEB5-201ENST00000602297 1216 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 AL671511.2-201ENST00000611838 659 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 AC073488.7-201ENST00000633785 778 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 UGP2-232ENST00000640075 567 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 OR8B2-202ENST00000641451 1056 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 ESRRG-212ENST00000463665 3359 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 ATAD1-202ENST00000328142 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 KIAA0232-201ENST00000307659 7841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 AC092378.1-202ENST00000500117 2296 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 DDX18-201ENST00000263239 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 FAM13C-219ENST00000621119 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 ADAMTS9-AS2-203ENST00000481312 1970 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 CD96-202ENST00000352690 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 AASDH-203ENST00000502617 3004 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 AC087516.2-201ENST00000558963 3042 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 SLC22A25-201ENST00000306494 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 OR10AB1P-202ENST00000641219 1686 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 LINS1-214ENST00000561308 1612 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 GPR1-203ENST00000437420 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 AC015969.1-201ENST00000366218 1416 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 RGS2-201ENST00000235382 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 ADGRE1-202ENST00000312053 3128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 TPPP2-201ENST00000321760 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 LIX1L-AS1-201ENST00000366105 377 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 RNU6-1242P-201ENST00000391052 103 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 MRPS33-202ENST00000393008 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 LINC00161-201ENST00000412526 870 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
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TOP3AQ13472 AC109638.1-201ENST00000417406 326 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 AL591468.1-201ENST00000417932 573 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 AL158070.1-201ENST00000421614 631 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 AL353148.1-202ENST00000424701 551 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 PRKG1-AS1-202ENST00000426785 1111 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 BX119904.1-201ENST00000432026 348 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 AL161793.1-201ENST00000435021 445 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 NPPA-AS1-202ENST00000446542 1032 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 AC104781.1-201ENST00000449838 397 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 AC004692.1-201ENST00000455430 424 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 TOPORSLP1-201ENST00000467693 2102 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 RPL23AP8-201ENST00000479812 475 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 RN7SL561P-201ENST00000488553 281 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 LINC02325-201ENST00000499910 1115 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 SNORA58-201ENST00000505219 137 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 AC122710.2-201ENST00000506093 596 ntTSL 4 BASIC6.36□□□□□ -1.39
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TOP3AQ13472 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
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TOP3AQ13472 AF117829.1-209ENST00000523995 767 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 AC055860.1-201ENST00000525523 688 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 AP000926.4-201ENST00000527351 454 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 REG4-204ENST00000530654 612 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 AP001257.1-201ENST00000533106 385 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 FAM66C-206ENST00000535567 724 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 AC124891.1-201ENST00000536322 519 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 AC008013.2-201ENST00000537555 348 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 AC130404.1-201ENST00000539362 739 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 AP003717.3-201ENST00000544832 1180 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 FLVCR2-204ENST00000553587 584 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 AL355075.3-201ENST00000554678 492 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 LINC02345-201ENST00000557883 766 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 LINC01582-201ENST00000560195 560 ntTSL 4 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 AC020978.2-201ENST00000563203 428 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 OR4C49P-201ENST00000563891 900 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 AC006441.4-202ENST00000577621 510 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 AC011824.1-201ENST00000584863 561 ntTSL 4 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TOP3AQ13472 AC002069.2-201ENST00000603580 883 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
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