Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 FOXP2-203ENST00000378237 2187 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 CAST-228ENST00000509903 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 LINC00690-201ENST00000429949 1365 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AC138915.4-201ENST00000565549 4147 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 ANKRD46-201ENST00000335659 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 LINC02547-201ENST00000531559 3308 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AC017002.4-201ENST00000604721 1525 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 NRK-201ENST00000243300 8062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AIG1-209ENST00000629020 3636 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 IARS-205ENST00000443024 4341 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 MED31-201ENST00000225728 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 MAPK10-251ENST00000640858 3052 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 LINC01772-201ENST00000457898 3245 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AC083806.2-201ENST00000617795 2685 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 SLC14A1-208ENST00000586142 2846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AC023886.2-201ENST00000321285 411 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 PDXDC1-201ENST00000325823 1113 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 FAM133CP-201ENST00000332869 704 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 XAGE3-201ENST00000346279 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 TRBV19-201ENST00000390393 552 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 NPM1P38-201ENST00000403835 865 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 RN7SKP273-201ENST00000411392 314 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AL158825.1-201ENST00000414735 521 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AC127537.1-201ENST00000418183 748 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 ELMO1-AS1-201ENST00000419535 528 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AL590095.1-201ENST00000420049 436 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
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FOXE3Q13461 AL138479.1-201ENST00000426913 484 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 P3H2-203ENST00000427335 2963 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 LINC01522-201ENST00000428999 429 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
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FOXE3Q13461 CFAP58-AS1-201ENST00000435434 795 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AC012485.2-201ENST00000437372 982 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AC239800.1-201ENST00000442049 719 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
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FOXE3Q13461 AC060834.2-201ENST00000447999 618 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
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FOXE3Q13461 AC115989.1-202ENST00000452153 1150 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
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FOXE3Q13461 LINC00533-201ENST00000456103 537 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
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FOXE3Q13461 AL034549.1-201ENST00000615120 578 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
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FOXE3Q13461 AC211433.3-201ENST00000623770 375 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 AL356121.2-201ENST00000624715 780 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 PDAP1-205ENST00000626285 120 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 LINC01359-206ENST00000634775 888 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 JAML-213ENST00000640745 951 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
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FOXE3Q13461 ECI2-204ENST00000380125 1405 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 PWRN1-211ENST00000568609 1443 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 DMTF1-213ENST00000432937 2411 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 CREM-206ENST00000354759 1589 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 ZNF679-202ENST00000421025 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 GRIK2-206ENST00000413795 4876 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 CENPJ-201ENST00000381884 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 DOCK9-203ENST00000376460 7549 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 ABCA9-201ENST00000340001 6514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 PSMD6-AS2-201ENST00000472046 2456 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 PIGN-238ENST00000639758 4239 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 THADA-207ENST00000405975 6114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 MUSK-205ENST00000374448 2754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 RND3-202ENST00000375734 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 KIAA0586-201ENST00000261244 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 DYNC2LI1-203ENST00000398823 2903 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXE3Q13461 PTPN2-212ENST00000591497 3390 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
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