Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
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TCOF1Q13428 AC087565.3-203ENST00000641018 837 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
TCOF1Q13428 ACOD1-202ENST00000449753 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
TCOF1Q13428 ASPM-203ENST00000367409 10887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
TCOF1Q13428 GOLGB1-202ENST00000393667 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
TCOF1Q13428 FNDC7-201ENST00000370017 3332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
TCOF1Q13428 ASH1L-202ENST00000392403 10979 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
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TCOF1Q13428 PLCB1-202ENST00000378637 3864 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
TCOF1Q13428 RNF145-201ENST00000274542 3364 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
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TCOF1Q13428 LINC01720-201ENST00000413356 2216 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
TCOF1Q13428 ZNF329-204ENST00000598312 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
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TCOF1Q13428 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC8.88□□□□□ -0.99
TCOF1Q13428 DLC1-201ENST00000276297 7447 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
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TCOF1Q13428 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
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TCOF1Q13428 JPX-212ENST00000639185 9658 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
TCOF1Q13428 NLGN4X-202ENST00000381092 3750 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
TCOF1Q13428 ADA2-210ENST00000610390 4137 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
TCOF1Q13428 OR6X1-201ENST00000327930 1058 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
TCOF1Q13428 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
TCOF1Q13428 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
TCOF1Q13428 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
TCOF1Q13428 RPL12P3-201ENST00000440080 396 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
TCOF1Q13428 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC8.85□□□□□ -0.99
TCOF1Q13428 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
TCOF1Q13428 OR5D15P-201ENST00000531671 942 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
TCOF1Q13428 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
TCOF1Q13428 FAM160A1-203ENST00000505231 4156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
TCOF1Q13428 VTCN1-202ENST00000359008 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
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