Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 AC020658.4-201ENST00000613987 684 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 AL391095.2-201ENST00000615228 378 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 SNX18P12-201ENST00000624821 759 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 CEACAM1-207ENST00000403444 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 GDNF-AS1-202ENST00000510986 1941 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 THRB-IT1-201ENST00000425296 1754 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 NXPE4-202ENST00000424261 1687 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 ART3-202ENST00000349321 1528 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 OR5AQ1P-203ENST00000641818 1529 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 AC008163.1-201ENST00000636281 1455 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 OR12D2-207ENST00000642051 1496 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 DDX1-208ENST00000621973 2183 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 RBM22-202ENST00000447771 1386 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 EEF1A1P9-201ENST00000514975 1383 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 ENKUR-201ENST00000331161 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 LINC00630-201ENST00000416381 2012 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 LINC01440-201ENST00000416190 1340 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 ADAM5-208ENST00000505455 1998 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 CEPT1-211ENST00000615636 1966 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 DEFB1-201ENST00000297439 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 TAF13-201ENST00000338366 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 OR52B6-201ENST00000345043 1008 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 OR2W4P-201ENST00000406496 926 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 ERI3-IT1-201ENST00000414156 619 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 AL121902.1-201ENST00000426963 459 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 PPIAP27-201ENST00000453800 265 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 HLA-DPA3-207ENST00000454398 229 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 NECTIN3-AS1-205ENST00000491709 792 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 CFAP44-AS1-202ENST00000498480 686 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 AC139722.1-201ENST00000512502 782 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 AC027343.2-201ENST00000513219 343 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 CCNHP1-201ENST00000513311 678 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 HAND2-AS1-233ENST00000515345 797 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 BFSP2-AS1-201ENST00000515542 894 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 RNA5SP340-201ENST00000517132 107 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 AC008663.1-201ENST00000519821 455 ntTSL 4 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 TRIM77BP-201ENST00000524985 1119 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 KCTD9P4-201ENST00000526766 1166 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 AC012555.2-201ENST00000549448 413 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 AC079950.1-201ENST00000551229 568 ntTSL 4 BASIC7.63□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 LINC01580-202ENST00000555364 661 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 AC092332.1-201ENST00000563684 829 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 AL049840.6-201ENST00000604583 345 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 AC108865.2-201ENST00000606881 432 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 AL096712.1-201ENST00000614561 159 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 MIR7159-201ENST00000620587 66 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 AC012254.5-201ENST00000623573 478 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 AC008691.1-209ENST00000642094 814 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
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CHAF1AQ13111 MYBL1-206ENST00000524176 2148 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
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CHAF1AQ13111 ADH1B-205ENST00000625860 4059 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
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CHAF1AQ13111 SLC41A2-201ENST00000258538 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 AC006213.6-201ENST00000623722 4179 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 AL137058.3-201ENST00000624531 3099 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
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CHAF1AQ13111 AL109610.1-201ENST00000414598 431 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
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CHAF1AQ13111 C3orf14-207ENST00000542214 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 AC107993.1-201ENST00000591343 684 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
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CHAF1AQ13111 LAPTM4BP2-201ENST00000604542 446 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 AL035587.1-202ENST00000607218 984 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 Metazoa_SRP.94-201ENST00000612609 250 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 AC010998.3-201ENST00000613871 631 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 Metazoa_SRP.199-201ENST00000615501 281 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 POU2F2-219ENST00000625670 371 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 OR8S1-202ENST00000641651 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 SLC2A14-221ENST00000616981 3366 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 AC006600.2-201ENST00000624834 2506 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 KRT39-201ENST00000355612 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 STMN2-201ENST00000220876 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 AC011455.2-201ENST00000599320 3336 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 ALG11-202ENST00000521508 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 TRPC1-205ENST00000612385 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 BABAM2-206ENST00000379632 1752 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
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