Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 AL021918.2-201ENST00000613415 194 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 MEIS1-201ENST00000272369 4291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 NCBP3-201ENST00000389005 12770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 CASR-205ENST00000639785 10047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 AC007620.2-201ENST00000600539 1697 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 LINC00615-201ENST00000546725 1406 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 G6PC2-202ENST00000375363 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 LINC01359-201ENST00000415842 1157 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 RPS15AP30-201ENST00000420976 390 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 AL590666.1-201ENST00000428641 433 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 AC115989.1-202ENST00000452153 1150 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 LINC01780-202ENST00000457683 391 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 AC108693.1-201ENST00000496068 432 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 PDE4D-225ENST00000515835 590 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 AP002754.2-201ENST00000542121 462 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 ETF1-203ENST00000503014 1736 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 PTPN3-202ENST00000374541 6703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 MC4R-201ENST00000299766 1666 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 FOXJ3-205ENST00000372573 5309 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 SMC1A-201ENST00000322213 9784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 LINC01128-205ENST00000445118 6606 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 ZNF252P-201ENST00000426361 5210 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 AC015689.2-201ENST00000528172 1738 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 CRP-204ENST00000368112 787 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 LINC01687-201ENST00000416327 795 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 HAO2-IT1-201ENST00000419144 311 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 AL355357.1-201ENST00000433531 417 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 EIF4A1P6-201ENST00000448133 1210 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 AC010260.1-201ENST00000511484 664 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 AL109935.2-201ENST00000587737 395 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 AC243960.1-203ENST00000595395 599 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 POU1F1-202ENST00000350375 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 MGAT5-201ENST00000281923 8144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 TMEM161B-211ENST00000512429 1796 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 GNL2P1-201ENST00000451274 2190 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 TRIM64-201ENST00000533122 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 TLR4-202ENST00000394487 3908 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 MCM10-201ENST00000378694 4587 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 AL138733.1-201ENST00000415477 853 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 AC092811.1-202ENST00000433058 656 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 NDUFS5P5-201ENST00000437256 321 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 AL353662.1-201ENST00000439099 327 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 AC092112.1-201ENST00000538329 640 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 AC108673.3-201ENST00000609183 335 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 OR11H2-202ENST00000641517 1085 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 RALYL-206ENST00000521376 1457 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 LSAMP-205ENST00000490035 9446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 VWA5A-205ENST00000456829 4388 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 HIPK1-211ENST00000626993 8016 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 NBPF9-203ENST00000610300 2930 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 TLN2-211ENST00000636159 7441 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 AC025370.1-201ENST00000523775 583 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 APPL2-203ENST00000546731 684 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 AC003682.1-201ENST00000599190 462 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 TGFB2-202ENST00000366930 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 UGT2B11-201ENST00000446444 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 CACNB4-239ENST00000636947 5575 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 CFAP57-204ENST00000528956 3037 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 CD200R1L-204ENST00000488794 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 OR8G5-203ENST00000641992 1560 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 ARHGEF11-202ENST00000368194 6889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 OR4K1-203ENST00000641429 1358 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 RPS24-201ENST00000360830 514 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
BPTFQ12830 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
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