Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 CU634019.4-201ENST00000623347 897 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TWF1Q12792 CASC22-202ENST00000628396 802 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TWF1Q12792 AC012564.1-201ENST00000636802 557 ntTSL 4 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TWF1Q12792 FGF13-201ENST00000305414 1939 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
TWF1Q12792 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TWF1Q12792 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TWF1Q12792 LGALS17A-201ENST00000412609 2562 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TWF1Q12792 ZNF138-204ENST00000437743 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
TWF1Q12792 AC112243.1-201ENST00000623949 3851 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
TWF1Q12792 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
TWF1Q12792 TRIM38-201ENST00000357085 9413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
TWF1Q12792 AHNAK2-201ENST00000333244 18254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TWF1Q12792 TCF7L2-218ENST00000538897 4000 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
TWF1Q12792 WDR95P-201ENST00000425638 1542 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TWF1Q12792 ZNF19-206ENST00000565100 2087 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TWF1Q12792 LRRFIP2-201ENST00000336686 3208 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
TWF1Q12792 DAZ2-202ENST00000382306 3781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TWF1Q12792 LINC02477-201ENST00000512652 1417 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TWF1Q12792 AC062029.1-202ENST00000606164 3651 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TWF1Q12792 AC113146.2-201ENST00000560743 1961 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
TWF1Q12792 NEPNP-201ENST00000404786 1371 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TWF1Q12792 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
TWF1Q12792 ICE2-201ENST00000261520 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
TWF1Q12792 ELMOD2-201ENST00000323570 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
TWF1Q12792 MAPK10-341ENST00000641657 3860 ntAPPRIS P2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TWF1Q12792 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
TWF1Q12792 REP15-201ENST00000310791 1078 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TWF1Q12792 MIR323A-201ENST00000362199 86 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TWF1Q12792 IFNB1-201ENST00000380232 859 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TWF1Q12792 FAIM-204ENST00000393035 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
TWF1Q12792 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TWF1Q12792 RNASE11-202ENST00000398009 1034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TWF1Q12792 RN7SKP161-201ENST00000411110 305 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TWF1Q12792 LIX1L-AS1-202ENST00000412239 570 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TWF1Q12792 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TWF1Q12792 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TWF1Q12792 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TWF1Q12792 OR13K1P-201ENST00000444577 975 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TWF1Q12792 AL009050.1-201ENST00000445278 426 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TWF1Q12792 HMGN1P36-201ENST00000446623 298 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TWF1Q12792 AL445238.1-201ENST00000450029 712 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TWF1Q12792 RPS27AP3-201ENST00000453803 454 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TWF1Q12792 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TWF1Q12792 LINC02503-201ENST00000510505 812 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TWF1Q12792 AP000648.1-201ENST00000529682 397 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TWF1Q12792 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TWF1Q12792 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TWF1Q12792 AL031601.1-201ENST00000605702 394 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TWF1Q12792 AC008280.3-201ENST00000606436 732 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TWF1Q12792 AL445465.1-206ENST00000609544 528 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TWF1Q12792 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TWF1Q12792 AC003992.1-201ENST00000635364 557 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TWF1Q12792 OR8G3P-202ENST00000641572 1255 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TWF1Q12792 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
TWF1Q12792 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TWF1Q12792 AL158064.2-205ENST00000640346 4082 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TWF1Q12792 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
TWF1Q12792 TEX9-203ENST00000558083 4440 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TWF1Q12792 AP000641.1-201ENST00000531988 1639 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TWF1Q12792 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
TWF1Q12792 NDST4-204ENST00000613194 3439 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TWF1Q12792 ZNF528-203ENST00000391788 4209 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TWF1Q12792 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TWF1Q12792 MTCO1P11-201ENST00000429111 1528 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TWF1Q12792 AC106872.5-201ENST00000508856 1416 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TWF1Q12792 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
TWF1Q12792 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
TWF1Q12792 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TWF1Q12792 CAV1-204ENST00000393470 598 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
TWF1Q12792 RN7SKP229-201ENST00000410465 302 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TWF1Q12792 SOX9-AS1-202ENST00000414600 742 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
TWF1Q12792 BMS1P10-201ENST00000443754 1120 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TWF1Q12792 AL445665.1-202ENST00000452436 324 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TWF1Q12792 AC023245.1-201ENST00000468501 517 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TWF1Q12792 AP001208.1-201ENST00000518612 408 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
TWF1Q12792 AC112191.2-201ENST00000522428 333 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TWF1Q12792 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
TWF1Q12792 CRYAB-205ENST00000526180 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
TWF1Q12792 AL049629.1-201ENST00000534431 648 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
TWF1Q12792 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
TWF1Q12792 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
TWF1Q12792 GNG2-208ENST00000554875 430 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
TWF1Q12792 AC020978.7-201ENST00000575953 1187 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TWF1Q12792 AC087301.1-201ENST00000579037 321 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
TWF1Q12792 AC020916.2-201ENST00000591242 360 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TWF1Q12792 LINC01966-201ENST00000595809 821 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
TWF1Q12792 AC009237.12-201ENST00000604755 742 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TWF1Q12792 AL021368.3-201ENST00000607119 578 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TWF1Q12792 AL009031.1-202ENST00000632370 886 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
TWF1Q12792 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
TWF1Q12792 MATR3-215ENST00000510056 3040 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
TWF1Q12792 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
TWF1Q12792 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
TWF1Q12792 AC096921.2-201ENST00000561507 1916 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TWF1Q12792 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
TWF1Q12792 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
TWF1Q12792 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
TWF1Q12792 NRCAM-202ENST00000379022 3900 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
TWF1Q12792 APOL4-203ENST00000352371 3227 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
TWF1Q12792 NUDT13-206ENST00000537969 2151 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.8 ms