Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 RAPH1-204ENST00000418114 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 NAT1-210ENST00000545197 1827 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 AL161912.4-201ENST00000623889 2468 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 CDK14-206ENST00000436577 4787 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 IFNB1-201ENST00000380232 859 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 PTPN20-208ENST00000395727 790 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 TMBIM4-203ENST00000398033 844 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 AL121835.1-201ENST00000404250 354 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 LINC01114-201ENST00000421071 482 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 C14orf105-202ENST00000422976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 AC092162.2-201ENST00000438143 532 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 AL590399.3-202ENST00000448491 495 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 TNS3-209ENST00000458317 1156 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 PFN2-209ENST00000481275 560 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 AC124945.1-201ENST00000485133 188 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 CCDC11P1-201ENST00000503137 1162 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 AC108941.2-201ENST00000506796 716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 AC105919.1-201ENST00000507203 393 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 AC022441.2-201ENST00000514113 382 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 HAND2-AS1-233ENST00000515345 797 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 AC109466.1-215ENST00000519750 516 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 NEDD8-203ENST00000524927 653 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 AL133481.2-201ENST00000538322 367 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 AC107958.1-201ENST00000556576 290 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 ANKRD20A5P-203ENST00000580200 566 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 MIR4271-201ENST00000582451 67 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 LINC00907-202ENST00000585639 915 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 GLYATL1P2-202ENST00000588046 902 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 AC068768.2-201ENST00000602352 343 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 NR1H5P-201ENST00000452683 1377 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 AC114876.1-201ENST00000490962 1366 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 ASNS-209ENST00000444334 1812 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 RASSF8-213ENST00000542865 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 AC004852.2-201ENST00000614289 2218 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 GNL2P1-201ENST00000451274 2190 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 LINC01470-202ENST00000506723 2193 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 HSPD1P8-201ENST00000400121 1658 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 ABCB11-201ENST00000263817 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 AMN1-208ENST00000537562 1538 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 AP004243.1-201ENST00000529108 1433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 PRIM2-201ENST00000274891 864 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 SNORA70.9-201ENST00000384370 135 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 PPP1R7-203ENST00000401987 820 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 AL451046.1-201ENST00000406097 534 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 AL359636.1-201ENST00000433572 522 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 AC007679.3-201ENST00000434035 414 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 RPSAP41-201ENST00000439695 860 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 SNRPCP3-201ENST00000474888 476 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 RN7SL741P-201ENST00000482473 289 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 RNA5SP473-201ENST00000516402 125 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 Vault.2-201ENST00000516519 98 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 RN7SKP35-201ENST00000517210 151 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 AC011853.1-201ENST00000518911 454 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 AC025366.1-201ENST00000523264 202 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 AP002370.2-201ENST00000531424 545 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 AP001893.1-201ENST00000532866 362 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 MED21-206ENST00000546323 575 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 DPPA3P2-202ENST00000557188 1219 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 AC009167.1-201ENST00000568317 579 ntTSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 AC136443.4-201ENST00000568759 579 ntTSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 TTN-AS1-226ENST00000588716 604 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 AC243967.1-201ENST00000598976 578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 AL136097.3-201ENST00000611097 505 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ACADSBP45954 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms