Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 OGDH-205ENST00000444676 3309 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 ETF1-201ENST00000360541 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 AC019322.4-201ENST00000623470 3930 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 COPA-202ENST00000368069 4664 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 TMEM169-205ENST00000454545 3460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.39□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 SYT1-202ENST00000393240 3095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 TSC22D1-212ENST00000611198 2877 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 TSC22D1-213ENST00000622051 2872 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC10.39□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 OLFM5P-201ENST00000411807 1478 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 SLC13A3-201ENST00000279027 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 ZPR1-201ENST00000227322 6566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 PPP2R5C-203ENST00000350249 3845 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 RN7SKP10-201ENST00000364291 325 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 LYZL2-201ENST00000375318 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 TUBB8P2-201ENST00000402141 495 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 AL359922.1-201ENST00000404796 935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 TMEM246-AS1-202ENST00000425734 466 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 AC244453.3-201ENST00000426275 459 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 AC002472.1-201ENST00000450652 563 ntTSL 4 BASIC10.39□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 AC008026.1-201ENST00000460492 447 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 RN7SL344P-201ENST00000485522 296 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 AC026826.1-201ENST00000493002 361 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 RNU1-125P-201ENST00000516752 129 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
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HOXD11P31277 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 OR7E87P-201ENST00000532397 929 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
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HOXD11P31277 BRWD1P2-201ENST00000546823 340 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 AC089984.3-201ENST00000552838 363 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
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HOXD11P31277 AC018943.1-202ENST00000569137 399 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 AC004840.2-201ENST00000603368 285 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 AC010087.1-201ENST00000618630 438 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 LINC02255-201ENST00000619758 199 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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HOXD11P31277 GLUD1P2-202ENST00000630097 606 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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HOXD11P31277 BCAR3-204ENST00000370247 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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HOXD11P31277 TMEM213-203ENST00000442682 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 TAF8-210ENST00000494547 2402 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 ZNF830-201ENST00000361952 2246 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 RNF123-201ENST00000327697 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 DDX11-202ENST00000350437 3724 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 FBXO8-201ENST00000393674 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 PDCD6IP-206ENST00000457054 5962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 TRIM49D1-202ENST00000530311 2164 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 CHRNA1-202ENST00000348749 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 AC006330.1-201ENST00000624598 1987 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 LINC02431-202ENST00000505329 1788 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 WDR91-201ENST00000354475 4588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 CALCOCO1-201ENST00000262059 5866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 AMD1-203ENST00000368882 3059 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 BTBD7-208ENST00000555525 2328 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 DLEC1-202ENST00000346219 5490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 CD300LF-203ENST00000343125 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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HOXD11P31277 CFAP69-201ENST00000389297 3902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 GPRASP2-205ENST00000543253 3935 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.39□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 DIAPH3-205ENST00000400324 4804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 LINC02078-201ENST00000592718 4237 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 TMEM69-201ENST00000372025 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 TCF12-202ENST00000333725 4719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 DDX25-201ENST00000263576 7555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 TRPV3-205ENST00000572519 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 ARHGEF3-201ENST00000296315 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 ZAN-207ENST00000620596 8396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 SLC2A12-201ENST00000275230 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 HSPA5-201ENST00000324460 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 PGLYRP4-201ENST00000359650 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 AC009779.3-202ENST00000550412 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 CCDC170-201ENST00000239374 5293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 DOCK8-201ENST00000382329 6124 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 SALL4-201ENST00000217086 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 PKMP5-201ENST00000454707 1601 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 C1orf131-201ENST00000318906 2483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 ATP5J2-202ENST00000359832 323 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 MAP3K7CL-205ENST00000399926 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 AL135905.1-201ENST00000416120 801 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC10.38□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 SNAI1P1-201ENST00000428587 777 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 AC097468.2-201ENST00000429343 553 ntTSL 4 BASIC10.38□□□□□ -0.75
HOXD11P31277 BX470209.2-201ENST00000442086 928 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
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