Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 AC026979.4-201ENST00000606555 645 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CIPCQ9C0C6 AC117490.2-201ENST00000610042 594 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CIPCQ9C0C6 AC092266.1-201ENST00000610958 165 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CIPCQ9C0C6 AC084824.5-201ENST00000612009 413 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CIPCQ9C0C6 Metazoa_SRP.94-201ENST00000612609 250 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CIPCQ9C0C6 AC009032.1-201ENST00000617574 431 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CIPCQ9C0C6 AC012254.5-201ENST00000623573 478 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CIPCQ9C0C6 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CIPCQ9C0C6 SEL1L3-203ENST00000502949 3500 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CIPCQ9C0C6 EIF3EP1-201ENST00000433978 1316 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CIPCQ9C0C6 RIOK2-202ENST00000508447 2149 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CIPCQ9C0C6 EEF1A1P24-201ENST00000451469 1378 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CIPCQ9C0C6 AC020743.2-201ENST00000639870 1370 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CIPCQ9C0C6 TMEM75-201ENST00000624314 2165 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CIPCQ9C0C6 YES1-203ENST00000577961 4554 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CIPCQ9C0C6 NEMF-201ENST00000298310 6234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CIPCQ9C0C6 VEPH1-202ENST00000392832 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CIPCQ9C0C6 GSTM2-207ENST00000460717 1449 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CIPCQ9C0C6 CLCC1-205ENST00000369969 4343 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CIPCQ9C0C6 BPESC1-201ENST00000418282 3522 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CIPCQ9C0C6 HEMK1-203ENST00000434410 17064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CIPCQ9C0C6 HHLA2-206ENST00000467761 2379 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CIPCQ9C0C6 AL592494.2-201ENST00000425455 1548 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CIPCQ9C0C6 PCNX4-201ENST00000317623 17339 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CIPCQ9C0C6 NPHP3-AS1-202ENST00000504440 2507 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CIPCQ9C0C6 CUL1-204ENST00000617797 2508 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CIPCQ9C0C6 AL133243.2-201ENST00000610331 1621 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CIPCQ9C0C6 HBS1L-212ENST00000527578 2618 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CIPCQ9C0C6 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CIPCQ9C0C6 AC061975.7-201ENST00000592016 2692 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CIPCQ9C0C6 C1orf27-202ENST00000367470 3754 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CIPCQ9C0C6 RNA5SP350-201ENST00000363298 111 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CIPCQ9C0C6 FETUB-203ENST00000382136 1040 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CIPCQ9C0C6 UBE2V1P15-201ENST00000407776 448 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CIPCQ9C0C6 U3.43-201ENST00000410734 213 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CIPCQ9C0C6 LINC00308-201ENST00000419431 727 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CIPCQ9C0C6 AC007064.3-201ENST00000422608 359 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CIPCQ9C0C6 CYP3A43-210ENST00000444905 733 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CIPCQ9C0C6 KRTAP2-5P-201ENST00000446109 396 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CIPCQ9C0C6 SEPHS1P4-201ENST00000446112 1176 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CIPCQ9C0C6 AC097463.1-201ENST00000447288 481 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CIPCQ9C0C6 ZNF736P6Y-201ENST00000447526 1213 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CIPCQ9C0C6 AL121970.1-201ENST00000447557 929 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CIPCQ9C0C6 PPIAP7-201ENST00000454070 489 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CIPCQ9C0C6 VPS25P1-201ENST00000455691 508 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CIPCQ9C0C6 RPL12P24-201ENST00000474907 486 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CIPCQ9C0C6 MTND6P8-201ENST00000503471 522 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CIPCQ9C0C6 C5orf64-204ENST00000507461 535 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CIPCQ9C0C6 AC119751.4-201ENST00000507498 357 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CIPCQ9C0C6 AC010374.2-201ENST00000512933 535 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CIPCQ9C0C6 AP000620.1-201ENST00000527147 504 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CIPCQ9C0C6 AC068768.1-204ENST00000544890 796 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CIPCQ9C0C6 AC078789.1-201ENST00000547084 477 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CIPCQ9C0C6 AC090680.2-201ENST00000550279 742 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CIPCQ9C0C6 AC092123.1-202ENST00000565310 405 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CIPCQ9C0C6 AC009054.1-201ENST00000568140 427 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CIPCQ9C0C6 AC008507.3-201ENST00000585753 472 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CIPCQ9C0C6 AL132655.1-201ENST00000601795 1153 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CIPCQ9C0C6 AC067773.1-201ENST00000603284 1094 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CIPCQ9C0C6 AP001823.1-201ENST00000604056 1003 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CIPCQ9C0C6 LAPTM4BP2-201ENST00000604542 446 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CIPCQ9C0C6 AC135803.1-201ENST00000608748 565 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CIPCQ9C0C6 AL391834.1-201ENST00000609609 560 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CIPCQ9C0C6 AC022106.1-201ENST00000612834 766 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CIPCQ9C0C6 AL391095.2-201ENST00000615228 378 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CIPCQ9C0C6 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CIPCQ9C0C6 AC004801.6-201ENST00000616571 978 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CIPCQ9C0C6 TMEM8B-202ENST00000377991 14112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CIPCQ9C0C6 TET1P1-201ENST00000426627 2301 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CIPCQ9C0C6 ATP8B5P-203ENST00000430846 3962 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 EEF1A1P21-201ENST00000512363 1344 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 KLHL2-210ENST00000538127 2907 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 LPAR6-201ENST00000345941 2428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 LRRC37B-202ENST00000341671 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AC016747.4-201ENST00000462959 1383 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 MED12L-206ENST00000474524 10744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 CHN1-204ENST00000409597 1445 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 ERMARD-202ENST00000366772 2003 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 ZNF578-201ENST00000421239 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 ZNF542P-202ENST00000467807 3209 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 FAM216B-202ENST00000537894 3300 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 MYBL1-206ENST00000524176 2148 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 DNHD1-212ENST00000527990 14298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AC018717.1-201ENST00000457712 1505 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 TESPA1-210ENST00000531122 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 GOLGA6L22-204ENST00000622895 4178 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AL157831.2-201ENST00000564681 3095 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AC025263.1-201ENST00000501387 2538 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 MEF2C-225ENST00000625585 3467 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 SEC61A2-202ENST00000304267 2030 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 ZNF573-201ENST00000339503 2014 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 ZNF484-202ENST00000375495 2867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 SAMD3-204ENST00000439090 2093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 MT4-201ENST00000219162 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 RN7SKP15-201ENST00000364742 309 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 FIG4-202ENST00000368941 791 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 SNORA51.9-201ENST00000384295 124 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 AL355143.1-201ENST00000407101 841 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CIPCQ9C0C6 RNU6-564P-201ENST00000410983 104 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
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