Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY5

MVB12A, Multivesicular body subunit 12A, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVB12AQ96EY5 AC012668.3-202ENST00000417485 1642 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
MVB12AQ96EY5 DICER1-201ENST00000343455 10277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
MVB12AQ96EY5 CACNB4-223ENST00000636380 1756 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
MVB12AQ96EY5 SRGAP3-213ENST00000618999 3929 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
MVB12AQ96EY5 PYHIN1-203ENST00000368140 2083 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
MVB12AQ96EY5 ZNF19-206ENST00000565100 2087 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
MVB12AQ96EY5 OPALIN-201ENST00000371172 3557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
MVB12AQ96EY5 AGO1-201ENST00000373204 13708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
MVB12AQ96EY5 PTPRT-209ENST00000612229 11285 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
MVB12AQ96EY5 SMAD5-211ENST00000545279 7012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
MVB12AQ96EY5 ANKRD44-202ENST00000328737 3686 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
MVB12AQ96EY5 DNAJC12-202ENST00000339758 1064 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
MVB12AQ96EY5 RGS1-201ENST00000367459 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
MVB12AQ96EY5 STAMBPL1-201ENST00000371922 1899 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
MVB12AQ96EY5 RSAD2-201ENST00000382040 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
MVB12AQ96EY5 ADAL-201ENST00000389651 1559 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
MVB12AQ96EY5 CAV1-203ENST00000393468 845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
MVB12AQ96EY5 TMBIM4-203ENST00000398033 844 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
MVB12AQ96EY5 RANP6-201ENST00000413691 644 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
MVB12AQ96EY5 PRKG1-AS1-202ENST00000426785 1111 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
MVB12AQ96EY5 DEFB130D-201ENST00000426866 237 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
MVB12AQ96EY5 AL357507.1-201ENST00000435946 669 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
MVB12AQ96EY5 AC128677.1-201ENST00000436016 442 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
MVB12AQ96EY5 LARS2-AS1-201ENST00000442534 575 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
MVB12AQ96EY5 AC017006.2-201ENST00000444077 464 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
MVB12AQ96EY5 AL392046.1-201ENST00000450742 569 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
MVB12AQ96EY5 C2orf80-206ENST00000451346 979 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
MVB12AQ96EY5 HMGB1P5-202ENST00000451497 985 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
MVB12AQ96EY5 AC104233.1-201ENST00000458107 339 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
MVB12AQ96EY5 CREM-228ENST00000473940 1182 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
MVB12AQ96EY5 AC079080.1-201ENST00000479841 822 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
MVB12AQ96EY5 PHLDB2-211ENST00000481953 5474 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
MVB12AQ96EY5 CPHL1P-204ENST00000482639 584 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
MVB12AQ96EY5 MBNL1-217ENST00000485509 1023 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
MVB12AQ96EY5 HMGB1P38-201ENST00000490557 577 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
MVB12AQ96EY5 MBNL1-219ENST00000492948 1054 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
MVB12AQ96EY5 AC093870.1-201ENST00000506837 213 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
MVB12AQ96EY5 AC079858.1-201ENST00000507842 448 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
MVB12AQ96EY5 AC008957.1-203ENST00000508745 589 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
MVB12AQ96EY5 AC138517.1-201ENST00000515724 568 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
MVB12AQ96EY5 HYDIN-215ENST00000541601 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
MVB12AQ96EY5 CLEC5A-206ENST00000546910 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
MVB12AQ96EY5 AC079385.3-201ENST00000552415 809 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
MVB12AQ96EY5 AL096869.1-201ENST00000557622 559 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
MVB12AQ96EY5 CNEP1R1-204ENST00000562576 656 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
MVB12AQ96EY5 MIR212-201ENST00000586026 110 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
MVB12AQ96EY5 AL669831.5-218ENST00000591702 1873 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
MVB12AQ96EY5 AC012594.1-252ENST00000595011 876 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
MVB12AQ96EY5 AP002802.2-201ENST00000605877 235 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
MVB12AQ96EY5 VN1R9P-201ENST00000614184 867 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
MVB12AQ96EY5 AL359513.1-201ENST00000614364 557 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
MVB12AQ96EY5 OR8G7P-201ENST00000616658 848 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
MVB12AQ96EY5 AC087633.2-201ENST00000618611 725 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
MVB12AQ96EY5 AL669942.2-201ENST00000620352 697 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
MVB12AQ96EY5 CHRM3-AS2-209ENST00000628573 766 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
MVB12AQ96EY5 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
MVB12AQ96EY5 AC007603.3-201ENST00000636915 979 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
MVB12AQ96EY5 MAPK10-251ENST00000640858 3052 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
MVB12AQ96EY5 TGFB2-202ENST00000366930 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
MVB12AQ96EY5 UTP6-201ENST00000261708 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
MVB12AQ96EY5 NXF2B-204ENST00000618302 2884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
MVB12AQ96EY5 CLHC1-204ENST00000407122 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
MVB12AQ96EY5 MME-203ENST00000460393 5622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
MVB12AQ96EY5 GPATCH2L-201ENST00000261530 14007 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
MVB12AQ96EY5 USP9X-201ENST00000324545 12401 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
MVB12AQ96EY5 HSDL2-201ENST00000398803 2983 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
MVB12AQ96EY5 LIPF-201ENST00000238983 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
MVB12AQ96EY5 AC092725.2-201ENST00000567658 1389 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
MVB12AQ96EY5 MCTP2-201ENST00000357742 7555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
MVB12AQ96EY5 DCDC2-201ENST00000378450 3684 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
MVB12AQ96EY5 LINC01087-201ENST00000431979 3516 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
MVB12AQ96EY5 EYA3-204ENST00000436342 5943 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
MVB12AQ96EY5 MRPS27-201ENST00000261413 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
MVB12AQ96EY5 KIAA1549L-202ENST00000321505 11678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
MVB12AQ96EY5 PAK3-203ENST00000372007 8940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
MVB12AQ96EY5 C8orf22-201ENST00000303202 1499 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
MVB12AQ96EY5 CYBRD1-203ENST00000409484 1493 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
MVB12AQ96EY5 SLC26A5-205ENST00000393723 2174 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
MVB12AQ96EY5 SCN1A-204ENST00000423058 8191 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
MVB12AQ96EY5 AC092451.3-201ENST00000625067 1343 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
MVB12AQ96EY5 STON1-202ENST00000406226 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
MVB12AQ96EY5 AC007993.1-201ENST00000621298 2430 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
MVB12AQ96EY5 RAPGEF4-214ENST00000538974 3920 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
MVB12AQ96EY5 LINC01772-201ENST00000457898 3245 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
MVB12AQ96EY5 AC083806.2-201ENST00000617795 2685 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
MVB12AQ96EY5 SLC25A40-201ENST00000341119 4045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
MVB12AQ96EY5 EIF4G2-208ENST00000526148 4001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
MVB12AQ96EY5 IKZF3-215ENST00000535189 1996 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
MVB12AQ96EY5 CA1-222ENST00000523953 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
MVB12AQ96EY5 PCYT1B-201ENST00000356768 1289 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
MVB12AQ96EY5 RNU5B-4P-201ENST00000363508 111 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
MVB12AQ96EY5 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
MVB12AQ96EY5 RNU6-1263P-201ENST00000384601 106 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
MVB12AQ96EY5 MIR191-201ENST00000384873 92 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
MVB12AQ96EY5 AL133260.1-201ENST00000405720 405 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
MVB12AQ96EY5 ATF1P1-201ENST00000406040 927 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
MVB12AQ96EY5 METTL5-205ENST00000409837 936 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
MVB12AQ96EY5 EMX2OS-201ENST00000412075 1025 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
MVB12AQ96EY5 AC002511.2-201ENST00000413796 450 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
MVB12AQ96EY5 SMARCE1P1-201ENST00000417747 1186 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms