Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 AC037198.2-201ENST00000478845 733 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 MTND3P24-201ENST00000506306 329 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 TMEM161B-AS1-208ENST00000507736 630 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 LINC01091-201ENST00000508111 645 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 AC010245.1-201ENST00000511329 754 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 AC097501.1-202ENST00000514707 313 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 LINC02482-202ENST00000515205 422 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 AC093599.1-201ENST00000515232 562 ntTSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 AC025434.1-201ENST00000520705 460 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 POLR2K-203ENST00000522439 543 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 AC099520.2-201ENST00000523745 567 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 AP001978.1-201ENST00000526851 834 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 PRH1-204ENST00000539853 837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 LINC02413-201ENST00000549914 723 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 AC069240.2-201ENST00000550242 609 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 NR2F2-AS1-205ENST00000559505 1005 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 AC009120.3-201ENST00000563335 499 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 AC009021.1-201ENST00000566098 375 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 MDFIC2-201ENST00000567252 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 RN7SL208P-201ENST00000577964 296 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 AC090125.1-201ENST00000581541 493 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 AC010325.2-201ENST00000594114 260 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 AC125494.2-201ENST00000602431 657 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 AL671309.1-201ENST00000603750 544 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 AC135983.2-201ENST00000604301 628 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 AC073575.2-201ENST00000614212 627 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 AC021106.3-201ENST00000623925 531 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 CDH12-208ENST00000522262 3028 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 AC096921.2-201ENST00000561507 1916 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 AC123769.1-201ENST00000530992 3192 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 TLR1-201ENST00000308979 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 BMP10-201ENST00000295379 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 HACD3-211ENST00000569894 1471 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 SNRPG-201ENST00000272348 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 RNA5SP35-201ENST00000391257 129 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 AL035467.1-201ENST00000403583 686 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 RN7SKP137-201ENST00000411074 307 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 AC012451.1-201ENST00000412312 357 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 AC019130.1-201ENST00000413841 391 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 AL390195.1-202ENST00000416099 723 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 AC023141.6-201ENST00000429418 337 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 NDUFA5P10-201ENST00000432147 357 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 RPL17P35-201ENST00000432217 549 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 MED28P4-201ENST00000433137 572 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 HNRNPA1P18-201ENST00000433537 927 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 LINC00271-203ENST00000438618 1202 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 AC074367.1-201ENST00000438685 1125 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 AL513321.1-201ENST00000441175 761 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 SUMO2P1-206ENST00000445436 284 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 PARD3-AS1-201ENST00000446211 302 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 RPL7L1P3-201ENST00000455249 689 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 SRP68P2-201ENST00000456184 254 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 AC139491.5-201ENST00000510029 920 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 AC106800.3-201ENST00000511389 308 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 AC108120.2-201ENST00000512973 294 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 LINC02358-201ENST00000514413 465 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-467P-201ENST00000517027 110 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 C14orf159-213ENST00000519019 834 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 AP002812.2-201ENST00000525594 585 ntTSL 4 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 AP002954.1-201ENST00000526274 425 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 CASP1-206ENST00000526568 1061 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 C11orf65-206ENST00000529391 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 CASP1-216ENST00000534497 825 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 AC024145.1-201ENST00000535324 775 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 AC007068.2-201ENST00000543168 395 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 OR4N2-203ENST00000557677 1008 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 AC021483.2-201ENST00000567415 758 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 AC009054.1-201ENST00000568140 427 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 ODF4-202ENST00000584943 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 ZNF227-204ENST00000586228 569 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 LINC01841-201ENST00000586698 573 ntTSL 4 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 NDUFA3P1-201ENST00000588007 252 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 AC009237.12-201ENST00000604755 742 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 AL121830.1-206ENST00000608476 1254 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 SAMD9L-209ENST00000610760 1221 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 GBA3-207ENST00000613293 1233 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 GXYLT1P5-202ENST00000618830 589 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 SUPT3H-206ENST00000637763 498 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 LINC01224-203ENST00000596283 2766 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 AC084816.1-210ENST00000540895 1920 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
ANKRD42Q8N9B4 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
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