Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 MYLK-205ENST00000360772 10027 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 LAMB4-202ENST00000388781 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 CA1-222ENST00000523953 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 TEFM-204ENST00000580840 2109 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 FHL5-201ENST00000326771 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 SORBS1-211ENST00000371247 7354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 CLCC1-205ENST00000369969 4343 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 ALS2-201ENST00000264276 6644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 OR10AG1-201ENST00000312345 1016 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 AC002075.1-201ENST00000457396 676 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 AL139022.1-201ENST00000556127 486 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 AL392046.2-202ENST00000635301 1113 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 MTO1-202ENST00000370305 2174 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 AC096921.2-201ENST00000561507 1916 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 SLFN13-211ENST00000542635 5921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 ZNF329-201ENST00000358067 3290 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 LAMA3-203ENST00000399516 9834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 PRRC2B-203ENST00000405995 9157 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 BTN3A2-203ENST00000396934 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 SORBS1-210ENST00000371246 6931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 EOGT-208ENST00000540764 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 NAV2-201ENST00000349880 10960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 AC010327.2-201ENST00000587647 488 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 TACC2-229ENST00000515603 9101 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 AC005618.1-201ENST00000606901 3148 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 ADA2-203ENST00000399837 4505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 ZNF329-203ENST00000597186 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 PLEC-208ENST00000436759 14787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 GIGYF2-201ENST00000373563 5847 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 BRD7-202ENST00000394689 2145 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 HLTF-201ENST00000310053 5317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 LCP1-201ENST00000323076 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 MYRFL-201ENST00000299350 820 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 RPS27AP7-201ENST00000422792 455 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 AL162726.1-201ENST00000436084 455 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 ATXN3-206ENST00000502250 1259 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 AC021351.1-202ENST00000561394 701 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 KANK1-205ENST00000382297 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 KCNAB1-212ENST00000490337 3122 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
LAMA3Q16787 FAT3-206ENST00000533797 7894 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 FRMPD2-201ENST00000305531 4665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 HTR2A-201ENST00000378688 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 NDUFA12P1-201ENST00000455914 406 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 CXorf51A-201ENST00000458472 431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 MRPS22-205ENST00000478464 1065 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 DUBR-205ENST00000495228 411 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 AL132780.1-201ENST00000548819 556 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 AC243960.3-202ENST00000599770 594 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 ALDH2-201ENST00000261733 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 MYO7B-202ENST00000409816 6694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 MIPEPP2-201ENST00000422560 1819 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 Z98755.1-201ENST00000407015 1384 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 MED12-201ENST00000333646 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 PIEZO2-203ENST00000503781 8259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 PRRC1-204ENST00000512635 2726 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 TACC2-228ENST00000515273 9245 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 CYCSP42-201ENST00000450823 238 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 AC068707.1-201ENST00000451438 391 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 AC010230.1-202ENST00000506265 592 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 TMEM202-202ENST00000567679 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 ATXN3-203ENST00000393287 6770 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 PHACTR1-201ENST00000332995 5332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 RIOK2-202ENST00000508447 2149 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
LAMA3Q16787 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
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