Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 CEP85L-204ENST00000392500 1872 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 PZP-201ENST00000261336 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 AL050335.1-201ENST00000396909 869 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 AL035419.1-201ENST00000397037 564 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 AL132875.1-201ENST00000403623 949 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 SLC8A1-AS1-202ENST00000417875 344 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 AL513329.1-201ENST00000426575 657 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 PA2G4P6-201ENST00000438325 1197 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 CEACAMP9-201ENST00000442990 513 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 LINC01214-201ENST00000471222 335 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 RN7SL165P-201ENST00000477476 291 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 CASP5-209ENST00000531367 879 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 RPA2P3-201ENST00000533268 770 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 AC007569.1-202ENST00000547282 303 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 AC114488.3-201ENST00000581333 480 ntTSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 AC211433.1-206ENST00000595409 733 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 AC011497.2-201ENST00000600255 639 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 AL359513.1-201ENST00000614364 557 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 LRP2-201ENST00000263816 15808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 CARF-212ENST00000434998 1955 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 PROX1-201ENST00000261454 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 TEK-204ENST00000519097 3836 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 CARD8-202ENST00000391898 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 DLG2-201ENST00000280241 7730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 NEUROD4-201ENST00000242994 3953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 CCDC80-201ENST00000206423 12430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 SCUBE3-201ENST00000274938 7356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 AC125793.1-201ENST00000565238 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 ZNF28-201ENST00000339844 650 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 AC018450.1-202ENST00000465880 529 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 ARHGEF3-AS1-201ENST00000477246 489 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 AC110775.1-201ENST00000513721 462 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
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CHD4Q14839 AC127526.3-201ENST00000534291 450 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 OR1F2P-201ENST00000570470 933 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 AC106037.2-201ENST00000578583 447 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
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CHD4Q14839 AC011443.1-201ENST00000599484 365 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
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CHD4Q14839 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 CTNND1-201ENST00000358694 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 TACC1-207ENST00000519416 5510 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 TACC1-210ENST00000520615 5509 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
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CHD4Q14839 ASB4-202ENST00000325885 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 ZNF260-202ENST00000523638 5666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 CACNA1D-211ENST00000636570 6441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 CCDC93-201ENST00000319432 6896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 CCDC93-202ENST00000376300 6899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 SH3D19-203ENST00000409598 5284 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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CHD4Q14839 VTCN1-202ENST00000359008 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
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CHD4Q14839 EXD1-202ENST00000458580 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 LINC02249-202ENST00000562624 4260 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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CHD4Q14839 AC000095.2-201ENST00000424407 768 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
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CHD4Q14839 WBP1LP3-201ENST00000523033 208 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 OR6M2P-201ENST00000529831 871 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 LINC01146-207ENST00000557339 397 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 AC138907.7-201ENST00000568972 358 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 RN7SL371P-201ENST00000578099 267 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 CYCSP1-201ENST00000604815 315 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 TCL6_3.1-201ENST00000619064 137 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 AC084816.1-204ENST00000628326 631 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 NEDD9-216ENST00000620854 4086 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 OR2L13-202ENST00000641714 1948 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 CPS1-212ENST00000619804 1542 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 FOCAD-216ENST00000605086 4195 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 GNL2P1-201ENST00000451274 2190 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 CSNK1G1-202ENST00000561349 1756 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 CNOT7-201ENST00000361272 6913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 AC127024.8-201ENST00000623719 2094 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
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