Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 AC245047.2-201ENST00000441060 530 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 AL022319.1-201ENST00000458183 1167 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 NDUFB5P1-201ENST00000508134 564 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 AC110775.1-201ENST00000513721 462 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 AC113386.1-201ENST00000523584 381 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 AC066613.1-201ENST00000559977 1053 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 AC116651.1-201ENST00000609724 556 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 AL121612.2-201ENST00000612261 482 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 SLC8A1-AS1-239ENST00000631142 623 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 AJ009632.2-209ENST00000634853 933 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 MIR3681HG-201ENST00000412294 2183 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 SLFN13-204ENST00000526861 6004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.24
CACNA1SQ13698 TRRAP-201ENST00000355540 12590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 PZP-201ENST00000261336 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 SUPT20H-224ENST00000542180 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 SLC14A1-201ENST00000321925 3971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 MAT2B-201ENST00000280969 2226 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 OR5A2-202ENST00000641361 6655 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 KIDINS220-206ENST00000473731 7248 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 TNKS-206ENST00000518281 3897 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 AL139095.4-201ENST00000379928 500 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 ALG13-AS1-201ENST00000430794 195 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 AC108066.1-201ENST00000437261 596 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 AC099786.1-201ENST00000446238 670 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 AC091685.2-201ENST00000454924 864 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 WDYHV1-203ENST00000518125 880 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 LINC02129-201ENST00000564381 692 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 AC067852.5-201ENST00000589299 310 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 LINC01050-201ENST00000604485 760 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 AL512329.2-201ENST00000607350 548 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 AP002505.2-201ENST00000623585 696 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 ATXN3-216ENST00000545170 6950 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 AC006213.6-201ENST00000623722 4179 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 GRIA2-204ENST00000393815 5260 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 ARHGEF12-201ENST00000356641 6891 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 RAPGEF4-204ENST00000409036 3975 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 CTNND1-203ENST00000361391 6232 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 AC098679.1-203ENST00000505532 2227 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 LRRTM3-201ENST00000361320 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 CLEC4E-201ENST00000299663 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 FBXO40-201ENST00000338040 5929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 ERBB4-205ENST00000436443 12084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 SALL4P7-201ENST00000555779 3120 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 OR51E1-201ENST00000396952 3612 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 GBP1-201ENST00000370473 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 LINC01527-201ENST00000419578 1997 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 AC079777.1-201ENST00000623836 1953 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 SPEF2-211ENST00000509059 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 TRPM8-201ENST00000324695 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 CSMD2-210ENST00000619121 13430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 LINC00284-201ENST00000423211 3208 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 POLR2B-202ENST00000381227 4108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 SUPT7L-202ENST00000404798 4114 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 MEPE-209ENST00000560249 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 AL034345.2-202ENST00000416948 830 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 CNOT7P2-201ENST00000441051 832 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 OR13K1P-201ENST00000444577 975 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 CT45A11P-201ENST00000448043 1134 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 OR56A7P-201ENST00000524865 941 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 AC244502.2-201ENST00000543361 851 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 AC008109.1-201ENST00000583163 826 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 AC245041.2-202ENST00000613389 493 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 AC007204.2-201ENST00000615022 616 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 SRPX2-201ENST00000373004 6679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 KAT6A-201ENST00000265713 9153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 AL353763.1-201ENST00000624467 1628 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 AC089998.1-201ENST00000548575 3141 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 NFIA-204ENST00000371187 2683 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 ESRRG-203ENST00000361395 5216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 ESRRG-209ENST00000408911 5216 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 LRRTM4-205ENST00000409911 2976 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 CEACAMP10-201ENST00000489959 1721 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 DLG2-201ENST00000280241 7730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 MIR1286-201ENST00000408112 78 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CACNA1SQ13698 AC022535.1-201ENST00000420082 691 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
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