Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 UBTFL2-201ENST00000411859 1191 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 C14orf105-202ENST00000422976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 FTO-202ENST00000431610 707 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 AL022324.2-201ENST00000434827 780 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 AC012594.1-271ENST00000438635 736 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 RN7SL502P-201ENST00000481857 290 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 LINC02025-201ENST00000488348 360 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 RAB7A-208ENST00000493186 329 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 AC018680.1-201ENST00000513332 875 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 AC091979.1-201ENST00000517595 706 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 MALAT1-203ENST00000544868 480 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 MYL2-203ENST00000548438 664 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 AC078778.2-201ENST00000553061 567 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 TPRX1P1-201ENST00000557620 319 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 AC013640.1-201ENST00000565366 565 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 C16orf97-205ENST00000568524 406 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 AL157938.2-209ENST00000589128 792 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 AC027334.1-201ENST00000603257 310 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 OR1N2-202ENST00000616791 993 ntAPPRIS P2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 BRCC3-209ENST00000620502 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 MALAT1-217ENST00000620902 352 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 MIR6503-201ENST00000622884 86 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 DAOA-AS1-201ENST00000448407 2482 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 RASSF8-213ENST00000542865 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 ESF1-201ENST00000202816 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 AC096921.2-201ENST00000561507 1916 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 MMAA-205ENST00000541599 1437 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 CCNT2P1-201ENST00000423082 1315 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 AC233968.1-201ENST00000611212 1300 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 AC022826.2-201ENST00000358757 776 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 SNORD35A-201ENST00000363389 86 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 MIR433-201ENST00000384837 93 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 RN7SKP129-201ENST00000410288 299 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 AC005162.1-201ENST00000416513 389 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 AL929472.2-201ENST00000419993 481 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 MGAT2P2-201ENST00000427194 797 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 GAPDHP75-201ENST00000433910 943 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 FBXW12-203ENST00000436231 1117 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 AL158850.1-201ENST00000441249 914 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 RPS19P6-201ENST00000441327 433 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 LINC02541-202ENST00000452675 465 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 L29074.1-201ENST00000456072 534 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 AC006947.1-201ENST00000457168 484 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 AP000926.3-201ENST00000497201 299 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 AC116345.3-201ENST00000508255 449 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 LINC01217-201ENST00000514427 562 ntTSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 CASP1P2-201ENST00000526830 1258 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 AC079089.1-202ENST00000528800 1256 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 AC022509.1-202ENST00000537525 494 ntTSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 AC105243.1-201ENST00000563172 1165 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 AC090286.3-201ENST00000573133 187 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 Metazoa_SRP.134-201ENST00000610965 327 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 SOX9-AS1-218ENST00000628742 733 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 AL596218.1-201ENST00000634239 1140 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 AJ009632.2-209ENST00000634853 933 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 AC003992.1-201ENST00000635364 557 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 TOP2B-201ENST00000264331 5358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 OR6N2-202ENST00000641131 3455 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 AL603750.1-201ENST00000624216 1717 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 TAAR1-201ENST00000275216 1020 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 SPP1-202ENST00000360804 1196 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 GPN3P1-201ENST00000423883 535 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 RNASE9-203ENST00000429244 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 PSMD8P1-201ENST00000436275 769 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 ATP5J2-205ENST00000449683 460 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 LINC01072-201ENST00000455848 431 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 SSBP1-205ENST00000465582 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 AC093719.1-201ENST00000480427 441 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 AC008945.1-201ENST00000505144 499 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 AC093664.1-201ENST00000511779 289 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CUL3Q13618 AC008429.4-201ENST00000521201 182 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
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