Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 CCDC13-AS1-202ENST00000446950 554 ntTSL 4 BASIC9.47□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 AL354989.1-201ENST00000448245 635 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 AC211433.1-201ENST00000450426 686 ntTSL 4 BASIC9.47□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 NECTIN3-AS1-202ENST00000467426 664 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 NDUFA5P9-201ENST00000472609 340 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 CT45A5-201ENST00000487941 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 SNRPCP11-201ENST00000492453 205 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 OR5AP2-201ENST00000544374 1006 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 CAPN3-210ENST00000561817 915 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 AC099511.1-201ENST00000564561 590 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 PPIAL4A-201ENST00000577856 660 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 AC069304.3-201ENST00000603938 1084 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 MIR8084-201ENST00000614105 89 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 AL136084.2-203ENST00000630758 690 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 LINC01646-202ENST00000634256 1107 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 LINC00598-209ENST00000635966 1148 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 AC099654.15-201ENST00000639802 509 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 COPS4-209ENST00000511653 1695 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 CENPJ-206ENST00000616936 5020 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 IL1RL1-202ENST00000311734 3994 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 LINC01205-201ENST00000489670 1331 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 REG1CP-201ENST00000377435 1705 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 RAB30-214ENST00000534141 3746 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 GCNT2-203ENST00000379597 4525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 PRRC2C-202ENST00000367742 10366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 SYT14-207ENST00000629778 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 CASC15-201ENST00000444265 1497 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 NFATC3-201ENST00000329524 6144 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 NIT2-201ENST00000394140 7289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 ALPK2-201ENST00000361673 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 ZNF607-202ENST00000395835 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 SPATA9-201ENST00000274432 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 SPP1-202ENST00000360804 1196 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 RNU1-84P-201ENST00000365447 164 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 MRPS6P2-201ENST00000381143 370 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 CEACAM1-208ENST00000403461 1263 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 RN7SKP221-201ENST00000410420 301 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
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NEUROD1Q13562 AL109807.1-201ENST00000438222 569 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 BX679664.2-201ENST00000439282 283 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 AL353768.1-201ENST00000439872 487 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 LINC02384-202ENST00000441255 567 ntTSL 4 BASIC9.46□□□□□ -0.9
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NEUROD1Q13562 RBMY2HP-201ENST00000457961 720 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 RABGAP1L-216ENST00000486220 772 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
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NEUROD1Q13562 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
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NEUROD1Q13562 RAB27A-212ENST00000569493 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
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NEUROD1Q13562 TMEM30CP-203ENST00000637814 1035 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 LINC01931-201ENST00000295052 1832 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
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NEUROD1Q13562 LINC00102-201ENST00000445785 1340 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 NIN-217ENST00000530997 8368 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 EPG5-201ENST00000282041 12633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 NUP210L-201ENST00000271854 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 SMC1A-202ENST00000375340 9930 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 NRK-201ENST00000243300 8062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 AC062022.1-201ENST00000451026 1684 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 INTS6-203ENST00000442263 15428 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 SULF1-201ENST00000260128 5710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 TRPC4-207ENST00000426868 2709 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 TMEM132B-201ENST00000299308 10906 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 FAM183A-201ENST00000335282 488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 DNASE2B-202ENST00000370665 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 PSMD10-206ENST00000372296 878 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 GNAT3-201ENST00000398291 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 PTGES3P2-201ENST00000407942 482 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 FAM183A-205ENST00000410048 500 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 FAM183DP-201ENST00000421987 399 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 TMEM246-AS1-202ENST00000425734 466 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
NEUROD1Q13562 AL008723.2-201ENST00000426354 562 ntTSL 4 BASIC9.45□□□□□ -0.9
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