Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 SERPINA1-208ENST00000448921 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 TCF4-203ENST00000398339 2551 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 RRN3-201ENST00000198767 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 FAM205BP-202ENST00000399773 4009 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 FAM135B-204ENST00000395297 6962 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 IFNE-201ENST00000448696 1475 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 EVI2A-203ENST00000462804 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 FAM13C-216ENST00000618427 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 PTGS2-201ENST00000367468 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 CHD7-203ENST00000525508 4777 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 NXF5-205ENST00000473265 1348 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AL008638.2-201ENST00000453934 2383 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 HPS5-201ENST00000349215 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AC006019.2-201ENST00000451116 3044 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 TRIM55-204ENST00000353317 2624 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 RAD51B-212ENST00000488612 1550 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 RASSF6-203ENST00000342081 4331 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AC131649.2-201ENST00000624925 4439 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 MICAL2-202ENST00000342902 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AC011294.1-202ENST00000451905 1947 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 CLIC5-201ENST00000185206 6023 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 TMEM43-201ENST00000306077 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 HYPM-201ENST00000341016 501 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 LINC01620-202ENST00000372910 649 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 IGHV2-5-201ENST00000390597 378 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 RNF212B-201ENST00000399905 1071 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AL031848.1-201ENST00000419034 351 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AC118470.1-201ENST00000419891 453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AL035045.1-201ENST00000425405 632 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AC002066.1-202ENST00000439070 699 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 LINC01185-201ENST00000439412 554 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 BMS1P10-201ENST00000443754 1120 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AC147651.1-201ENST00000453149 572 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 RPS18P13-201ENST00000461260 454 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AC124893.1-201ENST00000496247 545 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 RN7SL182P-201ENST00000496499 300 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 LINC00483-204ENST00000502517 940 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 OR5M14P-201ENST00000506803 618 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AC079209.2-201ENST00000519107 431 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 IGHVII-49-1-201ENST00000521760 224 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AP003385.2-201ENST00000524910 973 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AC135388.1-201ENST00000536512 353 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
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CLN3Q13286 MIR5192-201ENST00000579892 92 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AC093484.4-201ENST00000583934 461 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AC015802.3-201ENST00000590241 570 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 LINC01435-212ENST00000601212 742 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 ZNF677-211ENST00000601828 719 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AL050403.2-202ENST00000603462 492 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AC027506.1-201ENST00000621395 198 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AC245033.2-201ENST00000621893 421 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 MAPK10-280ENST00000641166 2684 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 MMACHC-203ENST00000616135 1510 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 GNA12-203ENST00000407904 3918 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 GRB10-207ENST00000402578 4760 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 ZNF701-201ENST00000301093 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 SSR1-210ENST00000489567 1893 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AC100771.2-201ENST00000525833 1350 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 ZSCAN9-207ENST00000531979 1601 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AC010533.1-201ENST00000624875 2105 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 TACC2-207ENST00000369000 3813 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AC244100.3-202ENST00000617328 1721 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 MMP13-202ENST00000340273 1470 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 KPNB1-202ENST00000535458 3163 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 FRG2-201ENST00000378763 2084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 FRG2B-202ENST00000443774 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AL034370.1-201ENST00000397254 1590 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 TAGAP-203ENST00000367066 3887 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 FMO5-202ENST00000369272 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 GTF2IP12-202ENST00000634317 5052 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 PHF7-211ENST00000615126 1328 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 WISP3-202ENST00000361714 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 TMCC1-203ENST00000432054 5631 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 CD180-201ENST00000256447 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 FOXP2-202ENST00000360232 1412 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AL157831.2-201ENST00000564681 3095 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 CYB5D1-201ENST00000332439 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 LYARP1-201ENST00000436977 1501 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
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