Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 LINC01966-201ENST00000595809 821 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 AP000904.1-201ENST00000609911 951 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 AC084816.1-204ENST00000628326 631 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 AL139254.3-201ENST00000641097 674 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 AMN1-208ENST00000537562 1538 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 AP002833.3-201ENST00000625075 2265 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 MUC4-215ENST00000475231 16273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 MS4A3-201ENST00000278865 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 SLC2A14-221ENST00000616981 3366 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 TRPM6-202ENST00000360774 8425 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 TMED3-202ENST00000424155 16555 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 NUMB-201ENST00000355058 3342 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 CBLB-205ENST00000407712 1493 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 NRG3-208ENST00000556918 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 LINC01613-201ENST00000561476 2780 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 TCF12-214ENST00000559710 1314 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 ANKRD12-203ENST00000400020 9115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 CCDC77-201ENST00000239830 2371 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 MELK-211ENST00000545008 2236 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 LINC02153-202ENST00000522604 1644 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 Y_RNA.110-201ENST00000363220 99 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 C1orf146-201ENST00000370373 871 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 SAMD13-204ENST00000370671 724 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 LIX1L-AS1-202ENST00000412239 570 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 AL096829.1-201ENST00000413677 457 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 AL035422.1-201ENST00000414193 397 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 AC074035.1-201ENST00000420725 1184 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 AL390879.2-203ENST00000426943 1121 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 RPSAP32-201ENST00000432681 526 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 AL590762.3-201ENST00000436372 640 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
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PGGT1BP53609 AC079612.2-201ENST00000446029 348 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
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PGGT1BP53609 AC004890.1-201ENST00000461005 181 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
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PGGT1BP53609 TMEM8B-202ENST00000377991 14112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
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PGGT1BP53609 AHNAK2-201ENST00000333244 18254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
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PGGT1BP53609 CLEC6A-201ENST00000382073 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 MGC4859-201ENST00000634803 3118 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
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PGGT1BP53609 IFI16-205ENST00000368132 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 AC027575.3-201ENST00000583058 2747 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 NBPF9-203ENST00000610300 2930 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 DMD-228ENST00000541735 7080 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 C3orf14-201ENST00000232519 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 DPH5-201ENST00000342173 1143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 FCGR1B-202ENST00000369383 570 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 GNG5P2-201ENST00000372054 207 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 LYZL1-201ENST00000375500 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PGGT1BP53609 SNORA70.9-201ENST00000384370 135 ntBASIC6□□□□□ -1.45
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