Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 SOX9-AS1-208ENST00000529667 340 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 AL158058.1-201ENST00000549515 647 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 AC009113.2-201ENST00000563182 403 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 AC010761.5-201ENST00000579468 287 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 MIR4433B-201ENST00000581329 102 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 LINC01198-204ENST00000594153 552 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 AC079395.2-201ENST00000610982 737 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 AC016769.4-201ENST00000616893 535 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 AL161457.2-201ENST00000629181 630 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 NHS-205ENST00000617601 8163 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 GABRA1-211ENST00000635880 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 NCOA6-202ENST00000374796 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 HSD17B13-202ENST00000328546 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 ALG10-201ENST00000266483 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 CCR9-204ENST00000422395 1331 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 CACNA1E-202ENST00000358338 14700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 LINC02086-202ENST00000492522 2091 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 ZSCAN5A-201ENST00000391713 3562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 CASP1-215ENST00000533400 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 ARL14EPL-201ENST00000601302 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 PDE4D-226ENST00000546160 7690 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 LSM5-203ENST00000409782 649 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 AC016994.1-201ENST00000425419 552 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 LINC01798-204ENST00000433396 682 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 AC108066.1-201ENST00000437261 596 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 AL133329.1-201ENST00000437466 478 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 LRRC37A14P-201ENST00000452297 462 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 RANP2-201ENST00000456833 229 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 APOPT1-204ENST00000473127 739 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 AC074087.1-201ENST00000512059 724 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 AC097537.1-201ENST00000514864 1213 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 AC010609.1-201ENST00000519375 569 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 AC008601.1-201ENST00000519892 527 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 LINC02451-201ENST00000546982 565 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 AC138123.2-201ENST00000550324 579 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 AL356801.1-201ENST00000559320 294 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 C16orf97-205ENST00000568524 406 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 AL008723.3-201ENST00000608926 449 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 IGF2R-201ENST00000356956 14044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 NSUN4-208ENST00000498008 3867 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 RNF4-214ENST00000511600 4123 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 NRCAM-205ENST00000413765 6406 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 GARNL3-202ENST00000373387 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 ZNF507-203ENST00000544431 5764 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 AMY1B-202ENST00000370080 1787 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 GOLGB1-202ENST00000393667 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 OLFM3-202ENST00000370103 3255 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 SAMMSON-210ENST00000641260 1308 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 NUP153-201ENST00000262077 5487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 AL050403.1-201ENST00000448859 2006 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
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HOXD10P28358 SORT1-209ENST00000538502 6993 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 PIK3CB-201ENST00000289153 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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HOXD10P28358 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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HOXD10P28358 ZNF619P1-201ENST00000446539 752 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 AC073909.1-201ENST00000447112 999 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
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HOXD10P28358 LINC01780-202ENST00000457683 391 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 DUTP7-201ENST00000507982 486 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 AL133372.2-203ENST00000508469 922 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 AC018709.1-201ENST00000509111 700 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 GAPDHP71-201ENST00000511530 1003 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 PFDN1-207ENST00000524074 395 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 C8orf59-206ENST00000545322 491 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 AP005230.1-204ENST00000579097 779 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 AC091151.1-201ENST00000587369 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 MIR548A1HG-202ENST00000637804 784 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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