Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 EIF4A1P1-201ENST00000420241 934 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 AC010890.1-202ENST00000432414 535 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 LRRC23-208ENST00000436789 796 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 AL121578.2-201ENST00000448797 447 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 ENTPD3-AS1-204ENST00000452768 724 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 RN7SL143P-201ENST00000496780 297 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 AC113404.1-201ENST00000502589 756 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 B3GNTL1P1-201ENST00000509174 289 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 LINC01060-205ENST00000512839 716 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 OR8G3P-201ENST00000533406 921 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 AC244502.2-201ENST00000543361 851 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 AC008147.3-201ENST00000548666 354 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 AC011611.5-201ENST00000552477 578 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 PPIAP6-201ENST00000557078 499 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 PWRN1-206ENST00000565512 433 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 AC090286.3-201ENST00000573133 187 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 MIR378C-201ENST00000578683 81 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 TTC39C-AS1-201ENST00000579713 817 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 ANKRD20A5P-203ENST00000580200 566 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 AC022146.1-201ENST00000595307 847 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 RMDN2-AS1-203ENST00000601029 613 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 AC015660.5-201ENST00000623238 564 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 AL357562.1-201ENST00000624911 609 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 PIGA-216ENST00000637296 2113 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 DUBR-202ENST00000466734 2737 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 NPFFR2-204ENST00000395999 1866 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 TMEM59-204ENST00000371344 2473 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 C11orf88-203ENST00000529167 3099 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 CDH17-202ENST00000441892 2204 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 AC107983.2-201ENST00000425211 4735 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 PDPR-210ENST00000568530 7223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 WDR44-202ENST00000371822 3877 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 BPIFC-203ENST00000397452 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 ZNF43-201ENST00000354959 2881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 PALM2-AKAP2-201ENST00000302798 4718 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 NT5C3A-201ENST00000242210 1670 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 TNPO1-204ENST00000506351 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 AKR1C1-202ENST00000380872 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 LINC01060-204ENST00000510832 2435 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 NEDD4L-207ENST00000435432 3417 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 FANCM-201ENST00000267430 7111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 AC093277.1-201ENST00000637776 1622 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 POLQ-201ENST00000264233 8775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 TOGARAM2-201ENST00000379558 12691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 VNN3-202ENST00000367927 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 MED6-212ENST00000615788 1700 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 SEC23IP-201ENST00000369075 7168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 REG1A-201ENST00000233735 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 IMPA1-202ENST00000311489 1106 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 ABCB4-202ENST00000358400 3826 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
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HOXD8P13378 S100A7L2-201ENST00000368725 339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
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HOXD8P13378 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 AL138828.1-204ENST00000413745 898 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
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HOXD8P13378 AC016994.1-201ENST00000425419 552 ntTSL 4 BASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 AL121759.1-202ENST00000425746 387 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 AC010148.1-201ENST00000427619 707 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 AL355607.1-201ENST00000427745 295 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 FGF12-202ENST00000430714 603 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 LINC01078-201ENST00000434832 387 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 RPEP4-201ENST00000437636 602 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 DCN-205ENST00000441303 519 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 AL139275.2-201ENST00000444731 539 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 AF130359.1-201ENST00000444868 438 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 PRDX1P1-201ENST00000449329 596 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 AL034369.1-201ENST00000453808 477 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 AC010878.1-201ENST00000456500 1047 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 LINC02499-201ENST00000502291 763 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 AC139718.2-201ENST00000506068 481 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 LINC01332-201ENST00000506612 502 ntTSL 4 BASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 AC087752.2-201ENST00000521219 281 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 C1GALT1P3-201ENST00000522049 819 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 OR4R3P-201ENST00000525084 838 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 CREBZF-209ENST00000534224 545 ntTSL 4 BASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 AC092851.1-201ENST00000535964 478 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
HOXD8P13378 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
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