Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 MIR7109-201ENST00000613748 65 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 Metazoa_SRP.66-201ENST00000615609 282 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 Metazoa_SRP.77-201ENST00000616915 252 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 AL158062.1-201ENST00000619632 745 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 AP001052.1-201ENST00000626421 99 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 AL078581.3-201ENST00000627304 744 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 AC073488.9-201ENST00000631601 754 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 PHEX-AS1-201ENST00000424650 1906 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 RAD51B-210ENST00000487270 2596 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 MUSK-206ENST00000416899 3344 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 AL353743.3-201ENST00000442109 1468 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 RBMS2-202ENST00000542360 1484 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 RARB-204ENST00000458646 2590 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 FANCD2-205ENST00000431693 2450 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 IL1R1-202ENST00000409329 1862 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 CLC-201ENST00000221804 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 CCL1-201ENST00000225842 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 PIH1D3-201ENST00000336387 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 RNU6-673P-201ENST00000365084 104 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 AC084816.1-201ENST00000413794 565 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 AC097721.1-201ENST00000427150 1253 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 AC092106.2-201ENST00000436597 487 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 AL138767.3-201ENST00000438082 495 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 AC092601.1-201ENST00000444526 383 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 LINC00189-203ENST00000447125 783 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 SPANXB1-201ENST00000449283 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 AC211433.1-201ENST00000450426 686 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 AC095033.1-201ENST00000451611 1096 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 CREM-228ENST00000473940 1182 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 RPL5P14-201ENST00000494197 878 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 AC093870.1-201ENST00000506837 213 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 SNX24-205ENST00000506996 588 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 AC091987.1-201ENST00000517758 464 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 DCN-209ENST00000546745 1026 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 APAF1-211ENST00000552268 1143 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 AL157871.6-201ENST00000553954 206 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 AC007496.2-201ENST00000564801 547 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 AP003774.2-201ENST00000569737 558 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 LINC01855-201ENST00000585520 396 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 RPL29P33-201ENST00000587474 316 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 AC091193.1-201ENST00000604640 448 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 AL589740.1-209ENST00000607032 1056 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 AL662797.2-201ENST00000607333 527 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 AC009779.8-202ENST00000607990 932 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 TCL6_3.1-201ENST00000619064 137 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 TTN-AS1-268ENST00000629094 604 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 ZNF211-205ENST00000391703 2239 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 SOHLH2-202ENST00000379881 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
FANCFQ9NPI8 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 CDKL4-201ENST00000378803 1567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 NBEA-207ENST00000537702 4089 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 TRAF5-201ENST00000261464 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 MCFD2-206ENST00000409800 3955 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 AC105235.1-201ENST00000623208 1816 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 AC009804.2-201ENST00000637566 3032 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 KIAA0895-201ENST00000297063 4153 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 SERPINB7-206ENST00000540675 2193 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 NAT2-201ENST00000286479 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 OR2M4-201ENST00000306687 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 PPARG-204ENST00000397000 1122 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 ABCA12-203ENST00000412081 485 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 TIMM8BP2-201ENST00000445940 251 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 AL020997.1-201ENST00000446554 349 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 AC068491.1-201ENST00000449539 1241 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 OR11I1P-201ENST00000486033 954 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 RPL29P23-201ENST00000486188 442 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 RN7SL568P-201ENST00000493069 298 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 AC104078.2-201ENST00000504344 541 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 RN7SKP34-201ENST00000516142 244 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 RN7SKP70-201ENST00000516655 271 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 ATP6V0E1-202ENST00000517669 502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 CYCSP25-201ENST00000525280 316 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 NOX4-213ENST00000531342 696 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
FANCFQ9NPI8 OR4A41P-201ENST00000533053 928 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms